发明名称 |
利用双S形函数曲线拟合和LEVENBERG-MARQUARDT算法及标准化的PCR肘确定 |
摘要 |
本发明涉及用于确定S形或生长型曲线中的例如肘值的特征过渡值、例如PCR扩增曲线中的周期阈值(Ct)的系统和方法。具有通过Levenberg-Marquardt(LM)回归方法所确定的参数的双S形函数被用于找到拟合PCR数据集的曲线的近似。一旦已经确定了参数,就可以利用一个或多个所确定的参数来使曲线标准化。如果选择用于计算扩增曲线的周期阈值的任意荧光水平(AFI)方法,则标准化对于确定周期阈值来说是有利的。在标准化之后,通过应用求根算法以确定表示标准化曲线的函数的根来处理该标准化曲线,所述根对应于周期阈值。该周期阈值然后被返回并可以被显示或另外被用于进一步的处理。 |
申请公布号 |
CN1987880A |
申请公布日期 |
2007.06.27 |
申请号 |
CN200610169377.5 |
申请日期 |
2006.12.19 |
申请人 |
霍夫曼-拉罗奇有限公司 |
发明人 |
L·弗兰西奥利;R·克诺贝尔;R·T·库尔尼克 |
分类号 |
G06F19/00(2006.01);G06F17/10(2006.01);C12Q1/68(2006.01);C12N15/09(2006.01) |
主分类号 |
G06F19/00(2006.01) |
代理机构 |
中国专利代理(香港)有限公司 |
代理人 |
卢江;梁永 |
主权项 |
1.一种计算机实现的、确定生长曲线的基线区域的末端处的点的方法,该方法包括以下步骤:-接收表示生长曲线的数据集,所述数据集包括多个数据点,每一个数据点都具有一对坐标值;-通过将Levenberg-Marquardt(LM)回归方法应用于双S形函数以确定该函数的参数来计算拟合所述数据集的曲线的近似;-利用所确定的参数使该曲线标准化,以生成标准化曲线;以及-处理该标准化曲线,以确定生长曲线的基线区域的末端处的点的坐标值。 |
地址 |
瑞士巴塞尔 |