监测丝状真菌细胞中基因表达的方法

摘要

本发明涉及监测多种基因在第一丝状真菌细胞中相对于所述基因在一或多种第二丝状真菌细胞中的差异表达的方法，其利用含有瑞氏木霉EST或SSH克隆或其组合的微阵列。本发明还涉及含有所述阵列特征的计算机可读介质以及基质，其用于监测多种基因在丝状真菌细胞中的表达。

主权项

1.监测相对于多种基因在一或多种第二丝状真菌细胞中的表达而言所述基因在第一丝状真菌细胞中的差异表达的方法，包括：(a)将分离自丝状真菌细胞的检测报道物标记的核酸的混合物加入含有瑞氏木霉EST或SSH克隆或其组合的阵列的基质，所述克隆或其组合选自SEQ ID NO.1-1188，SEQ ID NO.1-1188的核酸片段，与SEQ ID NO.1-1188具有至少90％同源性的核酸序列组成的组，其条件为所述标记的核酸与阵列中的EST或SSH克隆或其组合的互补序列杂交，其中来自第一丝状真菌细胞和一或多种第二丝状真菌细胞的核酸分别用第一检测报道物以及一或多种不同的第二检测报道物标记；和(b)在其中基因在丝状真菌细胞中的相对表达通过观察到的阵列中每个点的检测信号来测定的条件下检验所述阵列，其中(i)与获自第一或一或多种第二丝状真菌细胞的核酸杂交的、阵列中的瑞氏木霉EST或SSH克隆，或其组合分别产生不同的第一检测信号或一或多种第二检测信号，和(ii)位于阵列中并与获自第一和一或多种第二丝状真菌细胞的核酸杂交的瑞氏木霉EST或SSH克隆或其组合产生不同的组合检测信号。