模块式肽基试剂

摘要

本发明提供可以向其中引入一个或若干个相互作用的结构域的稳定肽骨架。这样的相互作用的结构域可以是特异结合结构域、抑制剂结构域、接头、标记、固相支持物、反应位点、催化位点、有用的化学实体、及试剂。相互作用的结构域向肽骨架的附着或整合产生肽基试剂。本发明还提供产生可用作相互作用的结构域的肽文库的方法。

主权项

1.一种方法，包括：a)定义含有靶蛋白上的相互作用位点的搜索范围，该肽可与靶蛋白相互作用；b)为该肽定义大小；c)为该肽的氨基酸序列中各位置定义氨基酸类别；d)用已定义的氨基酸类别中的各成员取代该肽序列氨基酸序列的各位置以生成包括输出肽序列集合的输出文库文档；e)将输出文库文档传输给分子对接程序以使各输出肽序列集合成员与搜索范围拟合并产生靶蛋白质-肽序列拟合得分；f)根据靶蛋白质-肽序列拟合得分将输出肽序列集合分级；和g)展示各输出肽序列集合成员及其关联靶蛋白质-肽序列拟合得分；其中，当附着于含有SEQ ID NO：11或14的肽骨架时，部分输出肽序列集合能够与靶蛋白质稳定地相互作用。