测定核苷酸序列信息的方法

摘要

本发明提供了核酸测序方法，该方法基于对寡核苷酸探针的拉曼特征的检测。检测各个被捕获的核酸探针的拉曼特征，可选地，所述核酸探针用拉曼标记或带正电荷的增强子标记。被捕获的探针的序列被用于鉴定被捕获的探针和互补的目标核酸的核苷酸序列，它们然后被比对，并被用于获得核酸序列信息。在另一实施方案中，提供了测定目标核酸的目标核苷酸位置上的核苷酸发生的方法，其利用目标核酸与结合该目标核酸的标记寡核苷酸探针的结合，其中标记的寡核苷酸探针包括第一标记和第二标记，所述第一标记能够影响第一标记的光学特性。

主权项

1.一种测定目标核酸的核苷酸序列的方法，包括：a)将该核酸或其片段与一群捕获寡核苷酸探针接触，以形成包括单链伸出端的探针-目标双链体核酸，所述一群捕获寡核苷酸探针结合到基质的一系列点位置上；b)将所述探针-目标双链体核酸与一群拉曼活性寡核苷酸探针接触，以允许所述拉曼探针与所述单链伸出端结合，其中每一拉曼活性寡核苷酸探针产生独特的拉曼特征；c)使用拉曼光谱术检测结合模板核酸的拉曼活性寡核苷酸探针；和e)鉴定每一个被捕获的拉曼活性寡核苷酸探针的点位置，从而测定所述目标核酸的核苷酸序列。