与表型药物抗性相关的HIV－1逆转录酶中的新突变分布型

摘要

本发明提供了与对HIV药物的表型抗性相关的HIV－1逆转录酶和/或蛋白酶基因的突变、突变结合或突变分布型。更特别地，本发明涉及HIV的目标群的基因型特征的应用以及为了在病毒突变分布型和药物抗性之间建立联系而随后在此信息与表型解释间建立的联系。本发明也涉及在数据库、药物开发即药物设计、药物修饰、治疗和处理设计、临床管理和诊断分析中使用本发明的突变分布型的方法。

主权项

1.包含选自下组的至少一个数据库的计算机系统：(i)一个将人类免疫缺陷病毒(HIV)逆转录酶中的至少一种突变的存在与至少一株HIV对逆转录酶抑制剂的抗性相关联的数据库，包含选自下列的至少一组记录：对应于选自44D、77L、115F、118I、184V、208Y、210W、211K、214F、215F、215Y、219E、219N及219Q的至少一种突变与对d4T的抗性间的关联的一组记录，对应于突变184I与对拉米夫定的抗性间的关联的记录，对应于选自115F和184V的至少一种突变与对阿巴卡夫的抗性间的关联的一组记录，对应于62V、75T、77L、116Y和151M的联合与对所有核苷类似物的抗性的记录，对应于选自101H、101P、103H、103S、103T、106M、181S和190Q的至少一种突变与对奈韦拉平的抗性间的关联的一组记录，对应于选自101H、101P、103H、103N、103S、103T、106M、181C、181S、190Q的至少一种突变与对地拉夫定的抗性间的关联的至少一组记录，对应于选自101H、101P、103H、103S、103T、106M、181S和90Q和236L的至少一种突变与对依法伏伦的抗性间的关联的一组记录，对应于184V和41L及215Y的联合的记录，其中184V抗性突变逆转了41L和215Y突变对齐多夫定的作用，对应于236L突变的记录，该突变提高了对奈韦拉平的敏感性，(ii)将人类免疫缺陷病毒(HIV)蛋白酶中的至少一种突变的存在与至少一株HIV对蛋白酶抑制剂的抗性相关联的一个数据库，包含对应于选自54L、54M、54V和84位密码子处的任意突变中的至少一种突变与对蛋白酶抑制剂的抗性间的关联的一组记录。