发明名称 | 建立和分析氨基酸序列构象的方法 | ||
摘要 | 本发明涉及建立和分析氨基酸序列构象的方法。特别涉及确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,从线性氨基酸序列开始的构象确定的方法,以及对比两个或更多个氨基酸序列的方法。 | ||
申请公布号 | CN1849611A | 申请公布日期 | 2006.10.18 |
申请号 | CN200480025709.1 | 申请日期 | 2004.09.08 |
申请人 | ACGT前基因组公司 | 发明人 | 杰拉尔德·伯姆;罗马·达鲁格 |
分类号 | G06F19/00(2006.01) | 主分类号 | G06F19/00(2006.01) |
代理机构 | 北京德琦知识产权代理有限公司 | 代理人 | 王琦;宋志强 |
主权项 | 1、一种用于确认给定的基于氨基酸的分子构象的方法,该方法包括如下步骤:a)将该基于氨基酸的分子分成相同长度的低聚肽,其中该低聚肽的数量优选由下式定义: n-(m-1)其中n是在该基于氨基酸的分子中氨基酸的数量,m是在该低聚肽中氨基酸的数量,并确定这些低聚肽的Ψ和Φ角(观测值);b)提供或准备低聚肽数据库,该数据库包含这些低聚肽的Ψ和Φ角的值;c)从该数据库信息中为步骤a)中确定的每个低聚肽确定Ψ和Φ角(预期值);d)从观测值中减去预期值;e)评价每个氨基酸位置的差异,其中预期值和观测值之间的差异越小,所述给定结构精确的概率越高。 | ||
地址 | 德国哈勒 |