对鲍氏志贺氏菌11型和大肠杆菌0105的O－抗原特异的核苷酸

摘要

本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌11型和大肠杆菌0105的O-抗原特异的核苷酸，它是鲍氏志贺氏菌11型(Shigella boydii 11)中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列。还包括O-抗原基因簇的结构以及源于鲍氏志贺氏菌11型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因(包括wzx基因或与wzx有相似功能的基因、wzy基因或与wzy有相似功能的基因)的寡核苷酸，并且包括获得细菌O-抗原基因簇的方法。本发明通过PCR证实它们对鲍氏志贺氏菌11型和大肠杆菌0105的O-抗原都有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌11型和大肠杆菌0105的方法。

主权项

1、一种对鲍氏志贺氏菌11型和大肠杆菌O105的O-抗原特异的寡核苷酸对，其特征在于，其寡核苷酸对是：SEQ ID NO：1中的4882至4900碱基的核苷酸和5283至5300碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5116至5133碱基的核苷酸和5386至5403碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4681至4697碱基的核苷酸和5373至5390碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5620至5638碱基的核苷酸和5980至5998碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5517至5536碱基的核苷酸和6323至6341碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5439至5457碱基的核苷酸和5831至5847碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6578至6596碱基的核苷酸和7014至7032碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6664至6682碱基的核苷酸和6882至6899碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6717至6735碱基的核苷酸和6977至6995碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的7502至7520碱基的核苷酸和7974至7992碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8019至8036碱基的核苷酸和8372至8391碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的7376至7394碱基的核苷酸和8219至8237碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8674至8691碱基的核苷酸和9200至9218碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8814至8832碱基的核苷酸和9139至9157碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8543至8560碱基的核苷酸和9053至9070碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的9727至9745碱基的核苷酸和10308至10325碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的9784至9802碱基的核苷酸和10015至10033碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的9430至9457碱基的核苷酸和10220至10239碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10484至10502碱基的核苷酸和10748至10765碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10599至10617碱基的核苷酸和11509至11527碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10997至11015碱基的核苷酸和11692至11710碱基的核苷酸。