废水生物处理系统中基于PCR的监测

摘要

用于废水生物处理的系统中的基于PCR的微生物监测。具体地，测定了指示/效应基因或者基因组合的丰度和表达这两者，其中“效应”基因的表达相关于一种特定的微生物样品的降解活性，而“指示”基因的丰度相关于微生物的丰度。效应基因的表达通过竞争性定量RT-PCR而进行测量，指示基因的丰度通过竞争性定量PCR而进行测量。该指示基因和效应基因可为相同或者不同的基因。在一个实施方案中，该指示基因和效应基因为来自草甘膦氧化还原酶(gox)基因的序列，并且该定量技术使用了竞争性定量PCR和竞争性定量RT-PCR。

主权项

1.一种优化废水处理系统的方法，该方法包括：a.从一种废水处理系统中进行废水取样；b.从所述的样品中收集固体；c.从所述的固体中分离DNA；d.从所述的固体中分离RNA；e.对所述的DNA实施定量PCR(qPCR)以测定指示基因丰度；f.对所述的RNA实施定量RT-PCR(qRT-PCR)以测定效应基固的表达；其中该指示基因丰度相关于所述样品的活性微生物含量(AMC)，其中该效应基因的表达相关于所述样品的活性生物除污物含量(ABC)，并且其中对该系统进行扰动，并且重复步骤a)至f)直至该AMC和ABC处于根据经验所确定的最优操作范围内。