发明名称 分泌性蛋白质家族
摘要 本发明涉及一族新颖的分泌性蛋白质,称作SECFAM3家族,它的家族成员包括新颖人蛋白质INSP123、INSP124和INSP125,经本发明鉴定为含有血管性血友病因子C型(vWFC)结构域的分泌性蛋白质;本发明还涉及这些蛋白质和编码基因的核酸序列在诊断、预防和治疗疾病中的用途。
申请公布号 CN1812998A 申请公布日期 2006.08.02
申请号 CN200480018446.1 申请日期 2004.04.30
申请人 阿雷斯贸易股份有限公司 发明人 D·米查洛维奇;I·姆肯里克;R·J·法根;C·鲍尔;M·优克
分类号 C07K14/755(2006.01);C12Q1/68(2006.01) 主分类号 C07K14/755(2006.01)
代理机构 上海专利商标事务所有限公司 代理人 余颖
主权项 1.一种鉴定SECFAM3家族成员的方法,其特征在于,所述方法包括:搜索翻译核酸序列或多肽序列数据库,鉴定一个与下列序列轮廓相匹配的多肽序列: A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -2 -2 -3 -4 -2 -1 -3 -4 -3 0 2 -2 8 0 -3 -2 -2 -2 -2 0 2 A 3 -1 -3 -3 -1 -1 -2 -2 -3 0 0 1 2 1 -2 -1 -1 -3 -1 1 3 L 1 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -2 2 0 2 -2 0 -2 0 1 -1 -3 -2 2 4 H -1 -1 1 -1 -3 -1 -1 3 6 -3 -1 -1 -2 -2 -2 2 -1 -3 -1 -3 5 I 0 -2 -3 -3 -2 0 0 -3 -3 3 2 -2 0 -1 -3 -2 -1 -3 -2 2 6 H 0 -2 -1 -2 -2 -1 -1 -3 7 0 0 -2 -1 -2 0 0 -1 -3 0 2 7 E 0 -2 -2 -1 -2 -1 2 -3 -1 0 1 -1 2 2 -3 0 -1 -2 2 0 8 A 2 -2 -1 -2 3 -2 -2 2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -2 3 1 -3 -3 -2 9 C 0 -3 -2 -3 7 -2 -3 -3 -3 0 -1 -2 3 3 -3 0 -1 -2 -1 010 I -1 -2 -2 -2 -2 -2 0 0 -2 3 2 -2 0 0 -3 0 0 -2 3 011 L -2 0 -3 -4 -2 -2 -3 -4 -3 0 4 -2 3 3 -4 -2 -2 -2 0 012 L 0 0 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -3 0 3 -2 0 -1 1 -2 -1 -3 -2 113 L -1 -2 -2 -2 -2 -2 0 -3 -3 0 3 -2 0 1 -3 1 1 -3 -1 114 V 0 0 -3 -3 4 0 -2 -3 -3 0 0 -2 2 -2 -3 -2 -1 -3 -2 415 I -1 0 -2 -3 4 -2 -2 -3 2 2 1 -2 0 -1 -3 0 0 4 -1 016 P 0 0 -2 -2 -2 -2 -2 -3 4 -1 0 -2 -1 2 3 0 -1 -2 0 017 G 0 -3 -2 -3 -2 -2 -3 2 -3 1 0 -3 3 3 -3 -1 -2 -2 0 118 L 1 -3 -3 -4 -1 -2 -3 -3 -3 0 4 -2 0 -1 -3 -2 -1 -3 -2 219 V 2 -1 -1 -2 -2 3 -1 -2 -2 0 -1 -1 -1 -3 -2 1 1 -3 -2 220 T -1 -2 -2 -3 4 -2 -2 -3 -3 0 3 -2 0 -2 -3 1 3 -3 -2 021 S 0 -2 -1 -2 4 -2 -2 1 -3 -1 1 -2 2 -2 0 2 -1 -3 -3 -122 A 3 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -1 -2 -1 0 -2 -1 1 2 2 -1 -3 -2 023 A 2 -2 -3 -2 5 0 0 -2 -3 -1 0 -2 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 124 I 1 1 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -2 2 0 -1 -1 -1 -2 2 -1 -3 1 125 S -1 -1 2 -1 -2 1 -1 -2 4 2 -1 -1 -1 -2 -2 3 -1 -4 -1 -126 H 0 -2 3 -1 -3 -1 -1 -2 5 -2 -2 -1 -2 0 3 0 -1 -3 -1 027 E -1 -1 0 1 -3 0 5 -2 -1 -3 -3 0 -2 -3 -1 1 2 -3 -2 -228 D 1 -2 0 4 -2 -1 0 -1 -2 -2 0 -1 -1 -2 -1 2 0 -4 -3 -229 Y -2 -1 -2 -2 -3 2 -1 -3 0 0 -1 -1 -1 0 3 -1 -2 0 5 030 P 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 0 5 -3 -3 -1 -2 -3 4 0 0 -3 -1 -231 A 3 -2 -2 -2 -1 -1 -2 -1 -3 0 2 -1 0 -2 0 0 0 -3 -2 032 D -2 -1 0 5 -3 0 2 -2 -1 -2 -3 2 -2 -3 -1 0 -1 -4 -3 033 E 0 -1 -2 0 -2 0 3 -3 -1 0 0 -1 0 3 -2 -1 -1 -2 0 034 G 1 -2 0 -1 -2 -1 -2 4 -2 -2 -2 -2 0 -2 -2 1 1 -2 -3 035 D 0 2 0 2 -2 0 0 -2 -1 -2 0 0 -1 -3 2 -1 -1 -3 -2 -236 Q 0 3 0 -1 -2 3 0 -2 -1 -2 -2 0 -1 -3 -1 1 3 -3 -2 -237 I 0 -2 -3 -2 -1 -2 -2 -2 -3 1 0 -2 0 -2 4 -1 -1 -3 -2 238 S -1 -1 0 1 -2 0 2 -2 -1 2 -1 1 -1 -2 -2 2 -1 -3 -2 039 S 3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 -1 -1 -2 2 3 0 -3 -2 -140 N 0 -2 2 -1 -3 -1 1 3 -1 0 0 -1 -1 -3 1 -1 -1 -3 -2 041 D 1 -2 -1 3 -2 0 2 -2 -2 -1 0 -1 -1 0 -2 0 -1 -3 -2 -142 N -1 -1 2 1 -3 0 3 0 -1 -2 0 0 -1 -2 -2 1 -1 -3 -2 -243 L 1 -3 -3 -3 4 -2 -3 -3 -1 0 1 -3 0 3 -3 -2 -2 0 5 044 I 1 -1 -1 0 -2 0 2 -2 -2 1 -1 1 -1 -2 -2 2 -1 -4 -2 045 F -2 -3 -2 1 -2 -2 -2 -3 -1 2 0 -3 0 4 -3 -2 -2 -1 4 146 D 1 -2 -1 2 -2 -1 0 0 -2 -3 -3 -1 -2 -3 4 1 -1 -4 -3 -247 D 0 -2 0 5 -3 -1 0 1 -2 -3 -4 -1 -3 -3 2 1 -1 -4 -3 -348 Y -2 3 -1 -2 -3 2 -1 -3 0 -2 -2 0 -1 0 -3 -2 -2 0 6 -249 R -2 4 0 -2 -4 2 0 -2 5 -4 -3 0 -2 -3 2 -1 -2 -3 -1 -350 G -1 -2 0 2 -3 -1 1 4 -2 -2 -3 -1 -2 -3 -2 1 -1 -3 -3 051 K -1 2 1 -1 -3 0 0 1 -1 -3 -3 4 -2 -3 -2 1 -1 -3 -3 -352 G -1 -2 -1 2 4 -2 -1 3 -2 -2 -3 -2 -2 0 -2 0 2 -2 -2 -253 C -1 -4 -4 -4 10 -4 -4 -4 -3 -1 -1 -4 -1 2 -4 -2 -2 -2 -1 -154 V -1 -2 -1 0 -2 -1 1 -2 -2 0 0 -1 3 -2 -2 1 0 -3 -2 355 D 0 -2 0 6 -3 0 1 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -356 D -2 -1 3 4 -4 0 2 2 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -357 S 0 -1 2 2 -3 1 0 2 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -2 3 0 -3 -3 -358 G 0 1 0 -1 -3 -1 -2 5 -2 -4 -4 -1 -3 -3 -2 1 -2 -3 -3 -359 F -1 -4 -4 -4 -2 -3 -3 -4 -2 3 0 -3 0 5 -4 -2 -1 -1 0 360 V -1 -3 -3 -2 -2 -1 1 -3 -1 0 0 -2 0 3 -3 -2 -1 -1 4 361 Y -2 -2 -2 -3 -2 -2 -2 -3 0 -1 -1 -2 -1 4 -3 0 -2 0 7 -262 K 1 -1 -2 -2 -2 -1 -1 0 -3 0 -1 1 -1 -2 2 -1 -1 -4 -2 363 L -1 -3 -2 -3 -2 -3 -3 4 -3 4 1 -3 0 -1 -3 -1 -2 -3 -2 064 G -1 -1 0 0 -4 0 3 5 -1 -4 -4 -1 -3 -4 -2 0 -2 -3 -3 -365 E -2 -1 -1 0 -3 3 3 -3 -1 -2 -1 0 3 -1 -2 -1 -2 7 -1 -266 R -2 2 -2 -3 -2 0 -1 -3 0 1 -1 1 -1 3 -3 -2 -2 -1 4 067 F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 -1 -1 -3 -1 6 -4 -2 1 6 3 -168 F 0 1 -2 -3 -2 -1 -2 -2 -1 -1 1 -1 0 2 -3 0 0 -1 2 -169 P -2 -2 -1 2 -4 0 2 -2 -2 -4 -4 -1 -3 -4 6 -1 -1 -4 -3 -370 G 0 -2 0 -1 -2 -1 -1 5 -2 -4 -4 -1 -2 -3 -2 3 -1 -3 -3 -371 H -2 -2 0 5 -3 -1 0 -2 4 -3 -4 -1 -3 -3 3 0 -1 -4 -2 -372 S -1 -1 0 -1 -2 -1 -1 -2 5 -3 -3 -1 -2 -3 4 3 1 -3 -1 -273 N 2 -2 2 -2 8 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 -3 -3 0 0 -3 -2 -174 C -1 -2 -1 -1 8 -1 3 -3 -2 -2 -2 -1 -2 -3 -2 0 2 -3 -2 -175 P -1 2 -2 -2 -3 3 0 -3 -2 -2 0 0 -1 -3 5 -1 -1 -3 -2 -276 C 0 -4 -4 -4 10 -4 -5 -4 -4 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -1 -1 -2 -2 -177 V -1 -2 -2 -1 -2 -1 2 -3 -2 0 2 -1 0 -1 -2 -1 0 -3 -2 378 C 0 -4 -4 -4 10 -4 -5 -4 -4 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -1 -1 -2 -2 -1 79 A 2 -1 -1 -1 -1 1 -1 -2 -2 -2 -2 -1 -1 -3 -1 0 4 -3 -2 -1 80 L 1 -1 -1 0 -2 0 2 -2 -2 -1 0 -1 -1 -2 -2 1 1 -3 -2 -1 81 D -2 -2 0 5 -4 0 4 -2 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -2 0 1 -4 -3 -3 82 G 0 -3 0 -2 -4 -3 -3 7 -3 -5 -5 -3 -4 -4 -3 0 -3 -3 -4 -4 83 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 1 -1 -4 -3 -3 84 V 0 -2 -2 -3 -2 1 -1 -3 -3 1 1 -2 0 -2 -2 0 -1 -3 -2 4 85 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -3 0 -1 -3 -3 -2 86 D 1 -2 -1 3 4 -1 -1 -2 -2 -1 -2 -2 0 0 -2 1 0 -3 -2 0 87 Q -1 3 -1 -2 -3 4 0 -3 -1 -2 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 0 88 P -1 -2 -1 -2 -2 -2 -2 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -4 6 0 4 -4 -3 -1 89 E -2 2 0 2 -4 0 5 -2 -1 -4 -3 1 -2 -4 -2 -1 -2 -4 -3 -3 90 C 0 -4 -4 -4 10 -4 -5 -4 -4 -2 -2 -4 -2 -3 -4 -2 -2 -3 -3 -2 91 P -1 -2 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 6 -1 2 -4 -3 0 92 K 0 3 0 0 -3 0 3 -2 -1 -3 -3 3 -2 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2 93 I -1 -3 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 3 3 -2 0 -1 -3 -2 1 -3 -2 1 94 H -1 -1 0 -1 4 -1 -1 -2 7 -3 -3 -1 -2 -2 2 1 -1 -3 0 -3 95 P 0 -2 -2 -1 -3 -1 1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 96 K 1 3 -1 -2 -2 0 0 -2 0 -2 -2 2 -1 -1 -2 1 -1 -2 2 -2 97 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -2 -2 -3 -2 -3 2 -1 -1 -3 -3 -2 98 T -1 -3 -2 -3 -1 -2 -3 -4 -3 4 0 -3 1 -1 -3 -1 3 -3 -2 2 99 K -2 1 0 -1 -4 0 2 -2 7 -3 -3 2 -2 -2 -2 -1 -2 -3 0 -3100 V -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 3 0 -3 0 -1 -3 -2 -1 -3 -1 5101 E 1 -1 0 3 -2 0 2 -1 -1 -3 -3 1 -2 -3 -1 2 0 -4 -3 -2102 H -2 2 1 -1 -3 0 -1 -2 7 -3 -2 0 -2 -1 -2 -1 1 -2 3 -2103 N -1 0 3 -1 -2 0 0 -1 4 -2 -2 1 -2 0 -2 1 0 -1 4 -2104 G -1 -1 0 2 -3 4 2 2 -1 -4 -3 0 -2 -3 -2 0 -1 -3 -2 -3105 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -5 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1106 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -5 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1107 P -1 -3 -3 -2 -3 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -4 7 -2 -1 -4 -3 0108 E -1 2 0 2 -3 4 2 -2 -1 -2 -1 0 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 0109 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -5 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1110 K -1 0 0 0 -3 0 3 -2 -1 -1 -2 3 -1 -3 -2 1 -1 -3 -2 1111 E 2 2 -1 0 -3 0 4 -2 -1 -3 -2 2 -2 -3 -2 0 -1 -3 -2 -2112 V -1 1 -1 -1 -3 -1 1 1 -2 1 -1 1 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 2113 K 0 0 0 -1 -3 0 0 4 -2 -4 -3 4 -2 -3 -2 1 -1 -3 -3 -3114 N -2 0 6 0 -3 0 0 0 0 -3 -3 2 -2 -3 -2 0 0 -4 -2 -3115 F -1 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -3 0 0 0 -2 0 4 -3 -2 -1 0 6 1116 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -5 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1117 E -1 -1 0 3 -3 0 4 -2 -1 -2 0 0 -2 -3 -2 0 1 -3 -3 -2118 Y -2 -2 -2 -2 -3 -1 1 -3 0 -1 -1 -2 -1 5 -3 -2 -2 0 6 -2119 H -2 5 2 -2 -3 0 -1 -2 4 -2 -1 0 3 -2 -2 -1 -1 -3 -1 -2120 G -1 -2 2 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3121 K -1 4 -1 -2 -3 0 0 -3 -1 -1 -2 5 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 0122 N -1 -2 2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 2 0 -2 0 -2 -2 0 4 -3 -2 1123 Y -2 -3 -3 -3 -2 -2 -3 -3 0 -1 -1 -3 -1 4 -4 -2 -2 1 8 -1124 K 0 1 0 -1 -3 2 2 -2 4 -3 -2 2 -1 -1 -2 -1 -2 -2 3 -2125 I -1 -2 2 -2 -2 -2 -2 -2 -2 2 1 -2 0 -1 -2 0 1 -3 -2 2126 L -1 -2 2 -2 -2 -2 -2 3 -2 0 3 -2 0 -1 -3 -1 -1 -3 -2 -1127 E -1 0 0 1 -4 3 6 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2128 E -1 -1 2 0 -3 0 4 -2 0 -3 -3 0 -2 -1 -2 0 1 -2 3 -2129 F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 7 -5 -2 -2 0 2 -1130 K -1 1 2 -1 -3 2 0 -2 -1 -1 0 2 1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 0131 P -1 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -3 -3 1 2 -2 0 -2 3 -2 0 -3 -2 3132 S 0 0 1 2 2 -1 0 -1 -1 -3 -3 -1 -2 -3 1 4 1 -4 -3 -2133 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 1 -3 -2 -2 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 0134 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 0 -2 -2 -1135 E -1 1 -1 0 -3 0 5 -3 -1 -1 1 0 -1 -2 -2 -1 -1 -3 -2 -1136 W -1 2 -1 -2 -3 2 0 -2 3 -2 0 1 -1 -2 -2 1 -1 4 -1 -2137 C 0 0 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 0 -1 -3 -1 -2 -3 -1 0 -3 -2 -1138 R -1 4 -1 -2 -2 0 -1 -3 -1 2 -1 2 -1 -1 -2 -1 1 -2 1 0139 C 0 -4 -4 -4 10 -4 -5 -4 -4 -1 -1 -4 -1 -2 -4 -1 -1 -2 -2 -1140 E -1 -1 0 2 -3 0 5 -3 -1 -2 0 0 -1 -3 -2 0 1 -3 -2 -2141 P 1 -2 1 -2 -2 -1 -1 -2 -2 0 0 -1 -1 -2 2 1 1 -3 -2 0142 S -1 -1 4 2 -3 1 0 2 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -2 2 -1 -4 -3 -3143 N -1 1 2 -1 -3 -1 -1 4 -1 -4 -4 1 -2 -3 -2 1 -1 -3 -3 -3144 E -1 0 -1 0 -3 0 4 -3 -1 1 -1 0 -1 -2 -2 -1 1 -3 -2 1145 V 3 -2 -3 -3 -1 -2 -2 -2 -3 0 0 -2 0 -2 -2 -1 -1 -3 -2 3146 H -2 1 -2 -3 -2 -1 -2 -3 3 0 2 -1 0 2 -3 -2 -2 -1 4 -1147 C -1 0 -3 -3 10 -3 -3 -3 -3 -2 -2 -2 -2 -3 1 -1 -1 -3 -3 -2148 V 0 -2 -1 -2 -1 -1 -2 -2 -3 0 1 -1 0 -2 -2 2 3 -3 -2 2149 V -1 -3 -3 -3 1 -2 -2 -3 -3 2 0 -2 0 -2 2 -2 -1 -4 -2 5150 A 3 -2 -2 -2 2 -1 -1 -1 -2 0 -1 -1 -1 -2 -2 2 0 -3 -2 2151 D 1 -2 0 5 -2 1 0 0 -2 -3 -3 -1 -2 -3 -2 1 -1 -4 -3 -2152 C -1 -3 -3 -3 10 -3 -4 0 -3 -2 -2 -3 -1 1 -4 -1 -2 -2 -1 -2153 A 2 -2 -2 -2 -2 -1 0 -2 -2 -1 0 -1 -1 1 4 -1 -1 -3 -1 -1154 V 2 -1 -2 -1 -2 4 1 -2 -2 -1 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -2 0155 P -1 -2 -1 1 -2 -2 -1 -2 -2 1 0 -2 -1 -2 4 0 2 -4 -3 0156 E -2 1 -1 0 -4 0 3 -3 2 -3 -3 1 -2 2 3 -1 -2 -3 -1 -3157 C -1 -3 -3 -3 9 1 -3 -3 -3 -2 -1 -3 -1 -2 -3 -2 -2 5 -2 -2158 V -1 0 -2 -3 -2 0 -2 -3 -3 2 0 -2 0 1 -2 -2 1 -2 -1 4159 N -2 1 4 4 -3 0 0 -1 0 -3 -3 -1 -2 -1 -2 0 -1 3 3 -3160 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 1 -2 -4 7 0 -1 -4 -3 -2161 V -1 -3 -3 -3 -2 0 0 -4 -3 4 0 -2 0 2 -3 -2 -1 -2 0 3162 Y -2 1 -1 -3 -3 -1 -1 -3 4 -2 0 -1 -1 0 -3 0 -2 0 6 -2163 E -1 -1 -1 0 -3 3 4 -3 -1 -2 -1 0 -1 -3 3 0 0 -3 -2 -2164 P -1 -1 -2 -1 -3 0 1 -3 -1 -2 -1 0 -2 -2 5 -1 -1 -2 2 -2165 E -1 -2 1 2 -3 -1 1 3 -1 -3 -3 -1 -3 -1 -2 0 -1 -2 2 -3166 Q -2 0 -1 -1 -3 4 2 -3 3 -3 0 2 -1 -2 -2 -1 -2 5 0 -2167 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -4 -3 0 0 -3 -1 -2 -3 -2 -1 -2 -2 0168 C 0 -3 -3 -3 9 -3 -3 -3 -3 0 -1 -3 -1 -2 -3 0 -1 -3 -2 1169 P 0 -2 -3 -2 -3 -1 -2 -2 -3 -2 0 -1 -1 -3 7 -1 -1 -4 -3 -1170 V -1 -2 -2 -2 -2 -1 1 -3 -2 3 0 1 0 -2 -2 -2 -1 -3 -2 4171 C -1 -2 -3 -3 9 -2 -3 -3 -3 -1 0 1 -1 -2 -3 -1 -1 -3 -2 -1172 K -1 1 0 -1 -3 0 0 -2 -1 -3 -2 6 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2173 N 2 -1 3 2 -2 -1 0 2 -1 -3 -3 -1 -2 -3 -2 1 -1 -4 -3 -2174 G 0 -1 0 -1 -3 -2 -2 5 -2 -4 -3 0 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3175 P -1 -2 1 -1 -3 -1 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 6 -1 -1 -4 -3 -2176 N -1 -1 5 0 -3 -1 -1 -1 0 -3 -3 -1 -2 -2 -2 1 0 6 -1 -3177 C -1 -2 -2 -2 8 -2 -2 -3 3 -2 -2 -2 -2 -2 1 -1 0 -3 -1 -2178 F -2 -2 -1 -2 -3 -2 -2 1 4 -2 -2 0 -1 4 0 -1 -2 0 3 -2179 A 2 -2 -2 -3 -1 -2 -2 2 -3 0 1 -2 0 0 -2 -1 -1 -3 -1 1180 G 0 -1 0 0 -2 -1 1 3 -2 -2 0 -1 -1 -2 1 1 1 -3 -2 -1181 T 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -2 -2 1 -1 -1 -1 -2 1 0 5 -3 -2 0182 T 1 -1 0 -1 -1 2 0 -1 -2 -1 0 -1 0 -2 -1 1 3 -3 -2 -1183 I 1 -3 -2 -3 -1 -2 -2 -2 -3 3 0 -2 0 -1 -2 0 0 -3 -1 3184 I -1 -3 -3 -3 -2 -3 -3 1 -3 5 0 -3 0 2 -3 -2 -1 -2 0 1185 P -1 -2 -2 -1 -3 0 1 -2 -2 -2 0 -1 -1 -3 6 -1 -1 -4 -3 -2186 A 4 1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 0 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0187 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 0 -2 -2 -3 0188 I -1 2 -1 0 -3 0 3 -3 -1 2 -1 0 -1 -2 1 -1 -1 -3 -2 0189 E -1 -1 -1 0 -3 0 4 -2 -1 0 -2 0 -1 -3 3 -1 -1 -3 -2 -1190 V 0 0 -1 1 -2 -1 -1 -2 -2 0 0 -1 0 -2 -2 -1 2 -3 -2 3191 K -1 0 -1 -1 -3 0 1 -2 -1 -2 -2 4 -1 -2 -2 -1 -1 7 -1 0192 V 0 -1 -1 -2 -2 1 0 -3 -2 0 0 1 0 -2 -2 -1 2 -3 -1 3193 D -2 -2 0 6 -3 0 1 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 1 -4 -3 -3194 E 1 -1 -1 1 -2 0 4 -2 -1 -1 -2 0 -1 -2 -1 0 -1 -3 -2 1195 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1196 N -1 -1 3 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 2 -2 0 4 -2 0 -1197 I -1 -1 -2 -3 5 -2 -2 -3 -3 4 0 1 0 -1 -3 -1 -1 -3 -1 1198 C 0 -3 -2 -3 9 -3 -3 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 1 -2 -2 -1199 H -2 2 0 -2 -3 0 0 -2 7 -3 -2 0 -2 0 -2 -1 -2 -1 3 -3200 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1201 H -1 0 0 -1 -2 0 0 -2 7 -2 -2 -1 -2 -1 -2 0 3 -2 0 -2202 N -2 -1 4 3 -3 0 0 -1 0 -2 -2 -1 -2 0 -2 0 -1 -1 4 -2203 G 0 -1 0 0 -3 0 3 5 -1 -4 -4 -1 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3204 D -1 0 0 4 -3 3 3 -2 0 -3 -3 0 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2205 W -1 -2 0 3 -3 -1 0 3 -2 -3 -3 -2 -2 -1 -2 -1 -2 8 0 -3206 W -2 -3 -2 -3 -2 -2 -3 3 -2 -3 -3 -3 -1 0 -3 -2 -2 11 0 -3207 K -1 3 0 -2 -3 0 0 -2 0 -2 -2 3 -1 0 -2 -1 -1 -1 4 -2208 P -1 -1 -1 -1 -2 3 0 -3 -1 -1 1 0 0 -2 4 -1 -1 -3 -2 -1209 A 5 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 0 0 -3 -2 0210 Q -1 0 -1 -1 -2 3 0 -2 -1 -1 0 0 4 -1 -1 0 2 -2 -1 0211 C 0 -3 -3 -3 10 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1212 S 0 -1 0 0 -1 0 0 -1 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 3 -3 -2 -1213 K -1 5 0 -2 -3 0 0 -2 0 -3 -2 4 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3214 R -1 3 0 -2 -2 0 -1 -3 6 -1 1 0 0 -1 -2 -1 -1 -2 0 -1215 E -1 0 0 1 -4 1 5 -2 0 -3 -3 3 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2216 C 0 -2 3 -1 9 -2 -2 -2 -1 -1 -1 -2 -1 -2 -3 0 -1 -3 -2 -1217 Q -1 2 -1 -1 6 3 0 -2 -1 -2 -2 1 -1 -3 -2 0 -1 -2 -2 -2218 G -1 0 3 0 -3 3 0 3 0 -3 -3 0 -1 -3 -2 0 -1 -3 -2 -3219 K -1 0 0 -2 -2 0 0 -2 5 0 0 3 3 -1 -2 -1 -1 -2 0 0220 Q -1 0 0 0 -3 4 4 -2 0 -3 -2 0 -1 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2221 T 0 -1 0 -1 -2 -1 -1 4 -2 -2 -2 -1 -2 -2 -1 0 4 -2 -2 -1222 V 0 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -3 -2 2 1 -1 4 0 -2 -1 0 -2 -1 3其中,当把所述序列轮廓作为查询序列输入到搜索程序BLAST时,采用生物信息国家中心(NCBI)确定的缺省参数[Blosum 62矩阵;空位开放罚分=11,空位拓展罚分=1],E值为10-2或以下的那些就是SECFAM3家族成员。
地址 瑞士欧博讷
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