对鲍氏志贺氏菌8型和大肠杆菌O143的O－抗原特异的核苷酸

摘要

本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌8型和大肠杆菌O143的O-抗原特异的核苷酸，它是鲍氏志贺氏菌8型(Shigella boydii 8)中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列，它是如SEQ ID NO：1所示的分离的核苷酸，全长15124个碱基；或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基，同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ ID NO：1的核苷酸。还包括源于鲍氏志贺氏菌8型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸。本发明通过PCR证实它们对鲍氏志贺氏菌8型和大肠杆菌O143的O-抗原都有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌8型和大肠杆菌O143的方法。

主权项

1、一种对鲍氏志贺氏菌8型和大肠杆菌O143的O-抗原特异的寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸对是：SEQ ID NO：1中的3455至3471碱基的核苷酸和3929至3946碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3635至3653碱基的核苷酸和4037至4056碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3740至3759碱基的核苷酸和4201至4220碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4843至4860碱基的核苷酸和5377至5394碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4889至4906碱基的核苷酸和5461至5479碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5391至5408碱基的核苷酸和5830至5847碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6032至6051碱基的核苷酸和6417至6435碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6220至6239碱基的核苷酸和6671至6689碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6087至6106碱基的核苷酸和6671至6689碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的7194至7211碱基的核苷酸和7822至7839碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6780至6797碱基的核苷酸和7222至7239碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的7010至7028碱基的核苷酸和7592至7626碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8211至8228碱基的核苷酸和8844至8861碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的7892至7911碱基的核苷酸和8414至8431碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的8038至8056碱基的核苷酸和8565至8582碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的12152至12171碱基的核苷酸和12915至12932碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的12312至12329碱基的核苷酸和12843至12860碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的9934至9952碱基的核苷酸和10513至10530碱基的核苷酸。