对鲍氏志贺氏菌13型的O－抗原特异的核苷酸及其应用

摘要

本发明提供一种对鲍氏志贺氏菌13型(Shigella dysenteriae 13)的O-抗原特异的核苷酸，它是鲍氏志贺氏菌13型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列。还包括O-抗原基因簇的结构以及源于鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因(包括wzx基因或与wzx有相似功能的基因、wzy基因或与wzy有相似功能的基因)的寡核苷酸，并且包括获得细菌O-抗原基因簇的方法。本发明通过PCR证实寡核苷酸对鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原有高度的特异性。本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的鲍氏志贺氏菌13型的方法。

主权项

1、一种对鲍氏志贺氏菌13型的O-抗原特异的寡核苷酸，其特征在于，所述的寡核苷酸对是：SEQ ID NO：1中的2012至2030碱基的核苷酸和2931至2949碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的1887至1904碱基的核苷酸和2599至2616碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的2009至2026碱基的核苷酸和2493至2510碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3252至3269碱基的核苷酸和4081至4099碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3206至3224碱基的核苷酸和4160至4176碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3565至3582碱基的核苷酸和4083至4100碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4399至4417碱基的核苷酸和4943至4962碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4368至4385碱基的核苷酸和4670至4688碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4227至4244碱基的核苷酸和4821至4840碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5242至5261碱基的核苷酸和5677至5694碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5071至5088碱基的核苷酸和5774至5791碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5600至5617碱基的核苷酸和5889至5908碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6089至6106碱基的核苷酸和6904至6921碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6306至6324碱基的核苷酸和6906至6923碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的6050至6067碱基的核苷酸和6996至7013碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10379至10397碱基的核苷酸和10953至10970碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10448至10465碱基的核苷酸和10813至10830碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10199至10217碱基的核苷酸和10098至11115碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的11472至11489碱基的核苷酸和11878至11894碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的11500至11517碱基的核苷酸和11686至11703碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的11689至11708碱基的核苷酸和11906至11923碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的11971至11990碱基的核苷酸和12872至12891碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的11973至11990碱基的核苷酸和12998至13015碱基的核苷酸；SEQ IDNO：1中的12682至12700碱基的核苷酸和12997至13014碱基的核苷酸。