蛋白质功能性的调控

摘要

提供了合理鉴别能够与天然产生的特定蛋白质相互作用的分子的新方法，以便产生新的药理学上重要的化合物和治疗模态。概括地说，所述方法包括鉴别形成感兴趣的特定蛋白质的一部分的开关控制配体，以及还鉴别形成蛋白质的一部分并与所述开关控制配体相互作用的互补的开关控制口袋的步骤。所述配体在体内与口袋相互作用以调节蛋白质的构象和生物活性，这样在配 体－口袋相互作用时所述蛋白质呈第一构象和第一生物活性，在所述配体－口袋相互作用不存在时呈第二种不同的构象。然后提供呈第一和第二构象的所述蛋白质的相应样品，并通过使样品与分子接触来筛选一种或多种候选分子。从而可鉴别在口袋区域结合蛋白质的小分子。还提供了新的蛋白质－调制剂加合物和改变蛋白质活性的方法。

主权项

1.一种鉴别与天然产生的特定蛋白质相互作用以调节蛋白质活性的分子的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：鉴别形成所述蛋白质一部分的开关控制配体；鉴别形成所述蛋白质一部分并与所述开关控制配体相互作用的开关控制口袋，所述配体在体内与所述口袋相互作用以调节所述蛋白质的构象和生物活性，从而在所述配体-口袋相互作用时该蛋白质呈第一构象和第一生物活性，并在所述配体-口袋相互作用缺乏时呈第二种不同的构象和生物活性；提供处于所述第一和第二构象的所述蛋白质的相应样品；以及通过使分子与一种所述样品接触，并鉴别在所述口袋区域与这种蛋白质结合以调节蛋白质活性的小分子，用一个或多个候选分子来筛选至少一种所述样品。