对大肠杆菌O172型的O－抗原特异的核苷酸

摘要

本发明提供一种对大肠杆菌O172型(Escherichia coli O172)的O-抗原特异的核苷酸，它是大肠杆菌O172型中控制O-抗原合成的基因簇的核苷酸全序列，如SEQ ID NO：1所示的分离的核苷酸，全长12850个碱基；或者具有一个或多个插入、缺失或取代的碱基，同时保持所述分离的核苷酸功能的SEQ IDNO：1的核苷酸；还包括源于大肠杆菌O172型的O-抗原基因簇中的糖基转移酶基因和寡糖单位处理基因的寡核苷酸；本发明通过PCR证实寡核苷酸对大肠杆菌O172型的O-抗原都有高度的特异性；本发明还公开了用本发明的寡核苷酸检测和鉴定人体及环境中的大肠杆菌O172型的方法。

主权项

1、一种对大肠杆菌O172型的O-抗原特异的寡核苷酸，其特征在于，其寡核苷酸对是：SEQ ID NO：1中的1166至1182碱基的核苷酸和1854至1870碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的1415至1434碱基的核苷酸和2286至2303碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的1157至1174碱基的核苷酸和1934至1951碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的2610至2627碱基的核苷酸和3452至3470碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的2711至2728碱基的核苷酸和3460至3477碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的2742至2759碱基的核苷酸和3480至3496碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3660至3677碱基的核苷酸和4255至4274碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3728至3745碱基的核苷酸和4296至4313碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的3752至3769碱基的核苷酸和4308至4325碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4391至4410碱基的核苷酸和5211至5228碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4463至4470碱基的核苷酸和5271至5289碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的4515至4530碱基的核苷酸和5396至5418碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5435至5452碱基的核苷酸和5992至6009碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5687至5704碱基的核苷酸和6230至6247碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的5724至5741碱基的核苷酸和6319至6336碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的9825至9842碱基的核苷酸和10687至10704碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10001至10017碱基的核苷酸和10682至10699碱基的核苷酸；SEQ ID NO：1中的10201至10218碱基的核苷酸和10954至10971碱基的核苷酸。