发明名称 精神分裂症相关基因TTR的多态性位点及其应用
摘要 本发明公开了一种与精神分裂症相关的基因TTR及其新发现的多态性位点,以及在检测精神分裂症方面的用途。本发明还提供了一种检测TTR基因的单核苷酸多态性的方法,并用上述方法在TTR基因的SEQ ID NO:1所示序列的第293位,SEQ ID NO:2所示序列的第224位、第265位、第322位和第352位检测到了四个新的单核苷酸多态性位点和一个9核苷酸缺失的位点。其中,位于第二号外显子293位的SNP1T→A的突变会造成氨基酸序列由谷氨酸到缬氨酸的改变,引起蛋白结构和功能的变化,等位位点A,即在其DNA互补链上为T等位位点,是产生精神分裂症的一个危险等位位点,其可应用于精神分裂症的诊断。
申请公布号 CN1683559A 申请公布日期 2005.10.19
申请号 CN200510024103.2 申请日期 2005.02.28
申请人 上海交通大学 发明人 贺林;杨异凤;万春玲;冯国鄞
分类号 C12Q1/68 主分类号 C12Q1/68
代理机构 上海交达专利事务所 代理人 毛翠莹
主权项 1、一种检测转甲状腺蛋白TTR基因多态性位点的方法,其特征在于包括如下步骤:1)用常规酚氯仿方法从人的血液中提取DNA,浓度校正至10ng/μl,作为DNA模板;2)设计寡核苷酸引物序列,用聚合酶链式反应扩增,反应体系为15μl,其中20μM正/反向引物0.3μl,2mM脱氧核苷酸1.5μl,含20mM镁离子的缓冲液1.5μl,DNA聚合酶0.15μl及DNA模板1.0μl和灭菌双蒸水10.25μl,退火温度为53度,退火时间为1分钟,扩增32个循环,得到TTR基因外显子区域的DNA序列;3)对扩增后得到的DNA序列进行测序,测序反应总反应体积5μl,PE ABI的Big Dye 3.1荧光标记的终止底物循环测序试剂混合物1μl,200ng基因组DNA,3.3pmol引物,循环参数:96℃,30s;50℃,30s;60℃,1min;循环30次,产物经乙酸钠/乙醇纯化后在DNA测序仪中进行自动测序,找出TTR基因外显子区域所有潜在的单核苷酸多态性位点。
地址 200240上海市闵行区东川路800号