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La presente provee un enfoque para desarrollar un algoritmo para determinar la efectividad de drogas antivirales en base a un análisis comprehensivo de datos fenotípicos y genotípicos pareados guiados por cut-offs clínicos fenotípicos. En un aspecto, el algoritmo permite proveer a un paciente de un tratamiento efectivo. Ayuda a predecir si un individuo infectado responderá al tratamiento con un compuesto antiviral, permitiendo así un régimen de tratamiento efectivo a desarrollar sin someter al paciente a afectos colaterales innecesarios. Además, se ahorra considerablemente tiempo y dinero, evitando la administración de drogas no efectivas. Reivindicación 1: Un método para determinar si un VIH tiene una probabilidad incrementada de tener una susceptibilidad reducida a un tratamiento con un inhibidor de la proteasa, que comprende la detección en la proteasa de dicho VIH o en un ácido nucleico de dicho VIH que codifica la proteasa, de la presencia o la ausencia de una mutación asociada con la susceptibilidad reducida al tratamiento con dicho inhibidor de la proteasa en la posición del aminoácido 20, 33, 34, 43, 46, 48, 50, 54, 55, 58, 63, 66, 73, 74, 76, 79, 82, 84 u 89 de la secuencia de aminoácidos de dicha proteasa, donde la presencia de dicha mutación indica que el VIH tiene una probabilidad incrementada de tener una susceptibilidad reducida al tratamiento con el inhibidor de la proteasa, con la condición de que dicha mutación no sea K20M, K20R, M46I, M46L, I54L, I54T, I54V, L63P, V82A, V82F, V82T o I84V.
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