METHOD AND DEVICE FOR SELECTING AND COMPARING PHYSICAL CHARACTERISTICS IN PARAMETER STRINGS

摘要

Die Figur betrifft ein Verfahren und eine Vorrichtung zum Vergleich von n Parameterfolgen, wobei jede Parameterfolge m-Parameter enthält und wobei die m-Parameter nach einer vorher definierten Vorschrift untereinander zu Parameterkombinationen kombiniert werden und jeder Parameterkombination nach einer vorher definierten ersten Bewertungsvorschrift ein erster Wert zugeordnet wird und das Ergebnis der Bewertungsvorschrift eine einer Messung zugängliche physikalische Eigenschaft entspricht, und wobei die Kombination aus den m-Parametern der nm-Parameterfolgen eine n-dimensionale Matrix bilden und einen Teil dieser n-dimensionalen Matrix ein aus arithmetischen logischen Recheneinheiten aufgebauten Matrix entspricht, wobei die arithmetischen logischen Recheneinheiten die Bildung der Parameterkombinationen mit Bewertung durchführen nur bei n und m gleich verschieden sein können und eine Zahle grösser als 1 darstellen. Weiter betrifft die vorliegende Erfindung einer Vorrichtung zur Durchführung des erfindungsgemässen Verfahrens, umfassend einen Prozessor und einen Hardwarebeschleuniger zur parallelen Datenverarbeitung, mnit dem ein weiterer Befehl oder Befehlssatz der in dem Befehlsatz des Prozessors nicht enthalten ist, zum Ausführen der Schritte des erfindungsgemässen Verfahrens realisiert wird und einem Speicher, der mit dem Prozessor gekoppelt ist. Das erfindungsgemässe Verfahren und die Vorrichtung finden insbesondere Verwendung zum Design und zur Auswahl von Primern, bei der Auswahl und Bestimmung von Oligonukleotidsequenzen, Materialeigenschaften sowie bei Datenbankabgleichen.