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Es ist ein Mikroskopsystem und ein Verfahren offenbart, das Spektren (60a, 61a, 62a, 63a und 66a) der im Objekt (15) vorhandenen Farbstoffe mit einem SP-Modul (20) aufnimmt. Es wird eine Transformation der Daten der ermittelten Spektren und der in einer Datenbank abgelegten Farbstoffspektren (60b, 61b, 62b, 63b und 66b) durchgeführt. Die Spektren werden in einen entsprechend in einen aufgeteilten Transformationsraum eingetragen. Das Zuordnen der Farbstoffspektren (60b, 61b, 62b, 63b und 66b) zu den gemessenen Spektren (60a, 61a, 62a, 63a und 66a) erfolgt durch einen Vergleich im Transformationsraum.
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