并行比较微生物群落结构的分子生态监测方法

摘要

并行比较微生物群落结构差异的分子生态监测方法属于微生物生态学领域。监测方法具体如下：(1)选定rep－PCR引物；(2)环境样品中混合微生物总基因组DNA的提取；(3)rep－PCR循环反应；(4)rep－PCR产物纯化，浓度测定；(5)纯化产物标记为探针；(6)待测生态系统微生物混合DNA的rep－PCR产物经1.2～1.5％琼脂糖凝胶电泳；(7)Southern－Blot检测，即印迹杂交检测。本发明具有简便、快速、灵敏的特点，可以同时平行分析不同生态系统的种群结构差异以及同一生态系统微生物种群结构的动态变化，为发现、鉴别和分离生态系统中优势功能菌以及为调控生态系统功能提供监测方法，可找到能显著提高活性污泥降酚能力的优势菌种，也可设计特异性检测肠道功能菌的探针和引物来评价益生素等的药效及筛选药物等。

主权项

1、一种并行比较微生物群落结构分子生态的监测方法，其特征在于监测方法具体如下：(1)选定rep-PCR引物；(2)环境样品中混合微生物总基因组DNA的提取；(3)rep-PCR循环反应；(4)rep-PCR产物纯化，浓度测定； (5)纯化产物标记为探针；(6)待测生态系统微生物混合DNA的rep-PCR产物经1.2～1.5％琼脂糖凝胶电泳；(7)Southern-Blot检测，即印迹杂交检测。