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Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Stabilisierung, Reinigung oder/und Isolierung von Nukleinsäuren aus Materialproben, insbesondere Stuhlproben, die Verunreinigungen und Inhibitoren bzw. Störsubstanzen enthalten können. Weiterhin wird ein für die Durchführung des Verfahrens geeigneter Reagenzienkit beschrieben. Gegenstand der Erfindung ist insbesondere ein Verfahren zur Reinigung, Stabilisierung oder/und Isolierung von Nukleinsäuren aus Materialproben, wobei man der Nukleinsäuren enthaltenden Probe einen Puffer zusetzt, der einen pH-Wert von 2 bis 7 hat, eine Salzkonzentration von mindestens 100 mM hat, oder/und eine phenolneutralisierende Substanz enthält. Durch das erfindungsgemässe Verfahren sind auf vereinfachte Weise saubere und amplifizierbare Nukleinsäuren aus fäkalen Proben erhältlich, die zum diagnostischen Nachweis von Infektionen, insbesondere bakteriellen oder Virusinfektionen, oder von Mutationen, insbesondere von tumorspezifischen DNA-Mutationen verwendet werden können.
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