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Utilisation d'au moins un polypeptide comprenant au moins un fragment d'une protéine pour obtenir une composition diagnostique, pronostique, prophylactique ou thérapeutique destinée à détecter, prévenir ou traiter un état pathologique associé à une maladie dégénérative et/ ou neurologique et/ ou auto-immune, ladite protéine étant choisie parmi les protéines dont la séquence peptidique à l'état natif correspond à SEQ ID Ndegre 1, SEQ ID Ndegre 2, SEQ ID Ndegre 3, SEQ ID Ndegre 4, SEQ ID Ndegre 5, SEQ ID Ndegre 6, SEQ ID Ndegre 7, SEQ ID Ndegre 8, SEQ ID Ndegre 10, SEQ ID Ndegre 11, SEQ ID Ndegre 12, SEQ ID Ndegre 13, SEQ ID Ndegre 14, SEQ ID Ndegre 15, SEQ ID Ndegre 16, SEQ ID Ndegre 17, SEQ ID Ndegre 18, SEQ ID Ndegre 19, SEQ ID Ndegre 20, SEQ ID Ndegre 21, SEQ ID Ndegre 22, SEQ ID Ndegre 23, SEQ ID Ndegre 24, SEQ ID Ndegre 25, SEQ ID Ndegre 26, SEQ ID Ndegre 27, SEQ ID Ndegre 28 et SEQ ID Ndegre 29, et les séquences peptidiques qui présentent au moins 70 % d'identité, de préférence au moins 80 % d'identité et avantageusement au moins 98 % d'identité avec l'une quelconque des séquences peptidiques SEQ ID Ndegre 1 à SEQ ID Ndegre 8 et SEQ ID Ndegre 10 à SEQ ID Ndegre 29, et les séquences peptidiques ou les fragments desdites séquences appartenant à une même famille de protéines choisies parmi le perlecan, le précurseur de la protéine plasmatique de liaison au rétinol, du précurseur de l'activateur du ganglioside GM2, de la calgranuline B et de la saposine B.
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