设计具有常见功能特性的化学结构的计算方法

摘要

本发明涉及建立在立体构型和结合亲和性的特定组合基础上,设计具有常见有用功能特性的化学结构的计算方法。更为特别的是,本发明提供了一种产生计算机模拟受体的方法,该受体可以模拟生物受体的功能。设计的模拟受体对已知目标分子具有优化的选择亲和性。由此可以确定化学结构并使该结构具有对模拟受体的选择亲和性。

主权项

1．一种基于计算机的用于设计具有预定功能特性的化学结构的方法，包括如下步骤：(a)产生一个由线性字符序列编码的模拟受体基因型物理模型，提供一组具有共有的至少一种可量化的功能特性的目标分子；(b)对每个目标分子； (ⅰ)对大量取向中的每一种取向采用一种有效的亲和性计算方 法计算受体和目标分子之间的亲和性； (ⅱ)对计算得到的亲和性进行加和，计算出加和亲和性； (ⅲ)确定一个最大亲和性；(c)应用计算得到的加和亲和性和最大亲和性 (ⅰ)计算最大亲和性与可量化的功能特性之间的最大亲和性相 关系数； (ⅱ)计算加和亲和性与可量化的功能特性之间的加和亲和性相 关系数；(d)利用最大相关系数和加和相关系数计算适应性系数；(e)改变受体结构并重复步骤(b)至(d)直到得到一群具有预先选定的适应性系数的受体；(f)提供一个由分子线性字符序列编码的化学结构的物理模型，运用所述的有效亲和性计算方法计算化学结构与大量取向中每一个受体之间的亲和性，应用计算所得的亲和性计算亲和性适应性值；(g)改变化学结构以便产生不同的化学结构，重复步骤(f)；以及(h)保持并进一步改变亲和性值接近预选亲和性值的化学结构的变量。