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Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Quantifizierung von Bakterien, wobei a) die DNA der Bakterien mit einem nicht natürlichen Analogon einer Nukleotidbase markiert wird, b) die Bakterien aus Stufe a) lysiert werden, c) die DNA der lysierten Bakterien denaturiert wird, d) ein enzym-gekoppelten Antikörper oder ein enzym-gekoppeltes Antikörperfragment gegen das nicht natürliche Analogon einer Nukleotidbase zugesetzt wird und e) nach Abtrennen der nicht an das nicht natürliche Analogon einer Nukleotidbase gebundenen Antikörper oder Antikörperfragmente, die gebundenen, enzymgekoppelten Antikörper oder enzym-gekoppelten Antikörperfragmente als Maß für die Bakterienanzahl bestimmt werden.
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