| 发明名称 | 蛋白质立体结构的预测装置及其预测方法 | ||
| 摘要 | 本发明提供通过再现转角来预测蛋白质的立体结构的蛋白质立体结构预测装置及其预测方法。氨基酸序列读入单元(110)读入作为一级序列的氨基酸序列，二级结构预测单元(130)预测其二级结构。在立体结构预测单元(200)中，转角信息计算单元(210)根据所预测的二级结构数据来计算形成转角的氨基酸的个数。将根据该二级结构和氨基酸的个数得到的有关存在概率高的转角结构的信息，存储在转角信息DB(230)内。转角预测单元(220)基于二级结构和所算出的氨基酸的个数来检索有关存在概率高的转角结构的信息。基于这些信息来再现所述转角。立体结构再现单元(240)使用所再现的转角，再现蛋白质的立体结构。 | ||
| 申请公布号 | CN100501726C | 申请公布日期 | 2009.06.17 |
| 申请号 | CN02824592.X | 申请日期 | 2002.12.10 |
| 申请人 | 富士通株式会社 | 发明人 | 酒井广太 |
| 分类号 | G06F17/30(2006.01)I;G06F19/00(2006.01)I | 主分类号 | G06F17/30(2006.01)I |
| 代理机构 | 北京三友知识产权代理有限公司 | 代理人 | 丁香兰 |
| 主权项 | 1. 一种蛋白质立体结构的预测装置，该装置根据氨基酸序列来预测由所述氨基酸构成的蛋白质的立体结构，其特征在于，该装置具有：转角信息存储单元，该单元将根据所述局部二级结构信息和所述氨基酸的个数预先从所述立体结构信息中提取的所述转角结构信息，与所述二级结构和形成所述转角的氨基酸的个数相关联进行存储；以及转角形成部分计算单元，该单元根据作为所述蛋白质的一级序列读入的所述氨基酸序列和由所述氨基酸序列得到的关于二级结构的局部的二级结构信息，计算形成转角的氨基酸的个数；转角预测单元，该单元根据所述二级结构信息和形成所述转角的氨基酸的个数，检索所述转角信息存储单元，取得与存在概率高的转角有关的转角结构信息，根据检索到的所述转角结构信息再现转角部分；以及立体结构再现单元，该单元使用所再现的转角部分，生成再现所述蛋白质的立体结构的再现信息。 | ||
| 地址 | 日本神奈川县川崎市 | ||