发明名称 一种从柽柳组织中提取总RNA 的方法
摘要 一种从柽柳组织中提取总RNA的方法,通过用试剂盒结合添加PVPP粉改进传统提取RNA的方法,使得不易提取的植物材料RNA提取效果和质量提高。主要的技术流程包括试剂盒设备提取前处理,提取RNA的详细过程,以及后期RNA浓度和质量控制检测。用该方法从柽柳组织中提取总RNA浓度高,质量好,没有蛋白质和其它的杂质污染。这项发明为提取荒漠中多盐多酚类的植物的RNA提取提供了参考。
申请公布号 CN105821032A 申请公布日期 2016.08.03
申请号 CN201610217611.0 申请日期 2016.04.11
申请人 中国科学院寒区旱区环境与工程研究所 发明人 燕霞;马小飞;钱朝菊;尹成亮;殷恒霞;石勇
分类号 C12N15/10(2006.01)I 主分类号 C12N15/10(2006.01)I
代理机构 代理人
主权项 一种从柽柳组织中提取总RNA的方法,该方法包括试剂盒设备提取前处理, 提取步骤,质量检测;其特征在于:所述试剂盒设备提取前处理:将离心管、药勺和研钵用0.1% DEPC的水溶液浸泡 12 小时,然后用铝泊纸包裹,高压蒸汽灭菌和干燥;用 70%酒精喷雾清洗离心机、试验台、试管架和移液器,然后用无菌纸巾擦干,反复2‑3次,确保实验台及实验所有仪器及设备无污染;所述提取步骤包括:1)在RNA Wash Buffer II 中加入48 ml 95% 的乙醇, 上下颠倒,充分混匀,备用;2)在5ml试管中加入E.Z.N.A® Plant RNA Kit (Omega Bio‑tek, Doraville, GA, USA) 裂解液RCL 4 ml,再加入4×20 μl的β‑巯基乙醇,盖上盖子,在涡旋振荡器上轻轻振荡,充分混匀,总体积共达4080 μl;3)用1000 移液器移取步骤2)中700 μl 裂解液RCL与β‑巯基乙醇的混合溶液, 加入1.5 ml 或 2 ml 经液氮预冷过的自备离心管中,放置预冷过的试管架上备用;4)称交联聚乙烯吡咯烷酮(PVPP)粉,PVPP粉的量为柽柳组织样品重量的2%,分别放入四个完全预冷并装有液氮的研钵中;5)在装有PVPP的研钵中,分别放入新鲜的或者液氮冷冻的柽柳根、茎、叶、花组织进行充分研磨; 把研磨后的柽柳根、茎、叶、花组织粉末,分别放入步骤3)盛有700 μl 裂解液RCL与β‑巯基乙醇的混合溶液1.5 ml 或 2 ml的 4个自备离心管中,盖上盖子,在涡旋振荡器上充分振荡2~5分钟,然后放入50℃水浴锅水浴,水浴期间取出振荡几次,充分混匀;所述研磨后的柽柳根、茎、叶、花组织粉末不能低于70 mg,而且不能超过100 mg;6)将步骤5)中装有样品和裂解液的4个离心管取出水浴,放入eppendorf离心机中,以14000 rpm转速离心 2分钟,取出离心管,放置在试管架上;7) 用1000 ul的移液器移取步骤6)离心管中的上清液600 μl到新的1.5 ml 或 2 ml 离心管中; 然后用移液器枪加入300 ul 的95% 的乙醇,枪头不出离心管,吸入排除反复5‑10次,至完全混匀;8)将HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱置放在2 ml收集管上,转移步骤7)离心管中所有溶液到HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱上,然后 10000 rpm离心 1分钟;9)弃掉收集管中的废液,重新在HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱上加入400 ul RWC Wash Buffer, 10000 rpm离心 30秒;10)弃掉收集管中的废液,用移液器取步骤1)配置好的 RWC Wash Buffer II 400 μl,加到HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱上,10000 rpm离心30秒;11) 分别加入预先配置的DNaseI 80 ul(70 ul DNase 酶,10 ul 共320 ul),放置15 分钟;然后用10000 rpm离心 30秒;倒掉收集管中的废液,再10000 rpm离心 20秒,甩掉管壁的残液;12)把HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱放置在新的1.5 ml 的收集管上,打开HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱盖子2分钟;13)在HiBind<sup>®</sup> RNA Mini 柱中央,加入30‑50 ul DEPC水后, 盖上盖子,静置3分钟;用14000 rpm离心 2分钟;得到的RNA放‑80℃存储;所述质量检测:1)Nanodrop 检测RNA质量,取 l ul提取的多枝柽柳(Tamarix ramosissima )根、茎、叶、花组织的 RNA 在NanoDrop 2000 仪器上检测,检测设定为 RNA,结果显示260/230 的值大于 1.5;260/280的值大于1.8;2)Bioanalyzer RIN值及rRNA Ratio检测,以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,检测结果在7.4和7.6之间,5S、18S及28S rRNA峰非常尖锐,RNA完整性好;3)琼脂糖电泳检测RNA质量,取500 ng提取的多枝柽柳的 RNA在1%的琼脂糖胶电泳分离,电泳电压为 105 V/cm,电泳时间为15 min ;Gel‑red染色,BioRad凝胶成像仪检测和照相;提取的 RNA 琼脂糖胶电泳检测具有5S、18S和28S三个条带,条带清晰可见。
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