鉴定细菌的多重PCR引物对组合及鉴定方法

摘要

本发明属于生物技术领域，提供了一种可用于细菌下一代测序的多重PCR引物对组合及鉴定细菌的方法。本发明利用引物对组合对细菌16S rDNA的V1‑V8可变区进行扩增，有效得到可变区序列；结合下一代测序和生物信息分析，能够灵敏、高效地鉴定细菌种属。

主权项

一种鉴定细菌的多重PCR引物对组合，所述组合包括用于扩增16SrDNA的V1‑V8可变区的引物对P1、P3、P5和P6，其中，引物对P1的扩增产物覆盖可变区V1和V2，引物对P3的扩增产物覆盖可变区V3和V4，引物对P5的扩增产物覆盖可变区V5和V6，引物对P6的扩增产物覆盖可变区V7和V8，其中引物对P1与P5组合使用，P3与P6组合使用；每个引物对均包含正向引物和反向引物，每条正向引物和反向引物的序列分别由以下部分组成：从5’端到3’端依次为：与测序通用引物互补的序列、标签序列和与16S rDNA保守区结合的序列；优选地，所述与测序通用引物互补的序列的长度为16～22个核苷酸，所述与16S rDNA保守区结合的序列的长度为14～24个核苷酸。