一种临床检测耳聋相关基因突变的HRM方法及试剂盒

摘要

本发明公开了一种临床检测耳聋相关基因突变的HRM方法及试剂盒。通过提取待测样本DNA，使用如SEQ ID NO.1‑30所示的引物进行PCR扩增和HRM扫描分析；根据扫描分析结果判断耳聋相关基因突变类型，HRM扫描分型无突变峰的样本为阴性，HRM扫描分型有突变峰的样本为阳性。本发明的试剂盒包含上述引物、质控品、PCR试剂和饱和荧光染料等；该试剂盒全部引物能在同一温度下进行PCR反应，检测灵敏度高，特异性强，反应体系小，检测样本来源丰富，反应简便迅速试剂价格低廉，高通量。本发明适用于临床新生儿遗传性耳聋基因筛查和优生优育孕前耳聋基因筛查，有助于指导优生优育和临床个体化用药。

主权项

一种基于HRM技术的耳聋相关基因突变检测PCR试剂盒，其特征在于：包含引物对A、B、C、D和/或E；其中，引物对A用于检测GJB2基因编码区第176位点16bp缺失突变，其为以下三对序列中的一对：A_F1：CAGGCCGACTTTGTCTG，A_R1：GGAGATGGGGAAGTAGTGAT；或A_F2：TGAGCAGGCCGACTTTG，A_R2：GAGATGGGGAAGTAGTGATCGTA；或A_F3：CGACTTTGTCTGCAACACC，A_R3：CCGGATGTGGGAGATGG；引物对B用于检测GJB2基因编码区第235位点C碱基缺失突变，其为以下三对序列中的一对：B_F1：CCACATCCGGCTATGGGCC，B_R1：GTGCATGGCCACTAGGAG；或B_F2：CTCCCACATCCGGCTATGGGC，B_R2：CATGGCCACTAGGAGCGC；或B_F3：CTCCCACATCCGGCTATGGGC，B_R3：CACTAGGAGCGCTGGCG；引物对C用于检测SLC26A4基因IVS7‑2A>G位点突变，其为以下三对序列中的一对：C_F1：ACAAGGAATTATTAAAACCAATGGAG，C_R1：ATGGCAGTAGCAATTATCGT；或C_F2：AACCAATGGAGTTTTTAACATCTTT，C_R2：TATGAAATGGCAGTAGCAATTATCG；或C_F3：AACCAATGGAGTTTTTAACATCTTT，C_R3：TTGGCTCCATATGAAATGGCA；引物对D用于检测mtDNA 12SrRNA基因C1494T突变，其为以下三对序列中的一对：D_F1：GTACACACCGCCCGTCA，D_R1：ATAAATGCGTAGGGGTTTTAGT；或D_F2：GTACACACCGCCCGTCA，D_R2：GGGTTTTAGTTAAATGTCCTTTGAAG；或D_F3：GTACACACCGCCCGTCA，D_R3：CGTAGGGGTTTTAGTTAAATGTCC；引物对E用于检测mtDNA 12SrRNA基因A1555G突变，其为以下三对序列中的一对：E_F1：CATTTAACTAAAACCCCTACGCA，E_R1：TTTCCAGTACACTTACCATGTTACGA；或E_F2：ACTTCAAAGGACATTTAACTAAAACC，E_R2：ACACTTACCATGTTACGACTTG；或E_F3：ACTTCAAAGGACATTTAACTAAAACC，E_R3：TTTCCAGTACACTTACCATGTTACGA。