鉴定tms5基因水稻种子的引物组及用其检测种子纯度的方法

摘要

本发明公开了鉴定tms5基因水稻种子的引物组及用其检测种子纯度的方法，包括TA突变型检测：设计上下游引物、野生型W1‑P、TA突变型M^TA‑PNFQ特异性探针；TC突变型检测：设计上下游引物、野生型W2‑P、TC突变型M^TC‑P特异性探针；用引物组检测种子纯度的方法：根据母本胚乳aa和F1子一代胚乳基因型Aaa，采用在F1子一代胚乳中梯度掺入母本胚乳，建立1％、5％、10％、15％、20％、30％、50％质量掺入比(母本/子一代)对应的实际测定拷贝数比a/A和理论拷贝数比a/A曲线，计算出种子的纯度；能快速鉴别水稻tms5不育系，检测灵敏度高、特异型好、检测时间短，可在1‑2小时内完成对tms5基因野生型和突变型的检测和区分；针对子一代种子纯度的检测比现有的方法检测周期短。

主权项

鉴定tms5基因水稻种子的PCR引物组，其特征在于，包括TA突变型检测：上下游引物、野生型W1‑P、TA突变型M^TA‑P NFQ特异性探针：上游引物P1‑F:TTACAGGCTAGATGTTGAAGAAGCA下游引物P1‑R:GTTTTGGCACGAAGCACGAT野生型W1–P探针:FAM‑TCCAACggctAGCAGTA‑NFQ突变型M^TA‑P探针:VIC‑CCAACgccAGCAGTA‑NFQTC突变型检测：上下游引物、野生型W2‑P、TC突变型M^TC‑P上游引物P2‑F:CGGCGACCTCCACCAC下游引物P2‑R:GCCCGCCGATGGAGATG野生型W2–P探针:FAM‑CCTTCGACTTCGGC‑NFQ突变型M^TC‑P探针:VIC‑CCTTCGCCTTCGGC‑NFQ 。