发明名称 |
基因变异检测方法及装置 |
摘要 |
本发明公开了一种基因变异检测方法及装置,包括:从基因比对结果中统计每个位点的比对信息;考虑碱基变异和插入缺失变异,创建16基因型模型;使用所述16基因型模型搜索候选变异位点;使用随机森林对候选变异位点进行分类与筛选,并输出筛选后的候选变异结果。本发明提供的基因变异检测方法及装置,能够同时检测单碱基变异和插入缺失变异,效率较高。 |
申请公布号 |
CN106611106A |
申请公布日期 |
2017.05.03 |
申请号 |
CN201611110748.2 |
申请日期 |
2016.12.06 |
申请人 |
北京荣之联科技股份有限公司 |
发明人 |
何光铸;王东辉;蔡文君;颜芹 |
分类号 |
G06F19/18(2011.01)I;G06F19/22(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/18(2011.01)I |
代理机构 |
北京风雅颂专利代理有限公司 11403 |
代理人 |
李莎;李弘 |
主权项 |
一种基因变异检测方法,其特征在于,包括:从基因比对结果中统计每个位点的比对信息;考虑碱基变异和插入缺失变异,创建16基因型模型;使用所述16基因型模型搜索候选变异位点;使用随机森林对候选变异位点进行分类与筛选,并输出筛选后的候选变异结果。 |
地址 |
100080 北京市海淀区北四环西路56号辉煌时代大厦10层1002-1 |