发明名称 |
一种用于构建微生物细菌16s rDNA可变区测序文库的扩增子引物及构建方法 |
摘要 |
本发明涉及一种用于构建微生物细菌16s rDNA可变区测序文库的扩增子引物及构建方法,引物由上游引物和下游引物构成,上游引物包括第一接头序列、第一测序引物序列、第一随机碱基序列和上游特异性靶序列引物;下游引物包括第二接头序列、标签序列、第二测序引物序列、第二随机碱基序列和下游特异性靶序列引物。并且采用所述引物可对微生物细菌16s rDNA进行一步法扩增子构建可变区测序文库。本发明增加文库复杂度,保证测序质量,避免了加入PhiX文库浪费测序通量;且本发明扩增效率高,不容易出现二聚体,能够准确快捷、成本低的进行细菌种群的鉴定。 |
申请公布号 |
CN106497926A |
申请公布日期 |
2017.03.15 |
申请号 |
CN201610954147.3 |
申请日期 |
2016.11.03 |
申请人 |
承启医学(深圳)科技有限公司 |
发明人 |
钟嘉泳;张弓;赵盼盼;王旭;孙黎;金静洁 |
分类号 |
C12N15/11(2006.01)I;C12N15/10(2006.01)I;C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12N15/11(2006.01)I |
代理机构 |
北京睿派知识产权代理事务所(普通合伙) 11597 |
代理人 |
刘锋 |
主权项 |
一种用于构建微生物细菌16s rDNA可变区测序文库的扩增子引物,所述引物由上游引物和下游引物构成,所述上游引物由5’端到3’端包括第一接头序列和第一测序引物序列,所述下游引物由5’端到3’端包括第二接头序列、标签序列和第二测序引物序列,其特征在于:所述上游引物还包括设置于第一测序引物序列下游的上游特异性靶序列引物,所述上游特异性靶序列引物的引物长度不超过30nt,该上游特异性靶序列引物与第一测序引物序列之间设有由5~10个随机碱基构成的第一随机碱基序列,每一个随机碱基均选自A、C、G和T中的任意一个;所述下游引物还包括设置于第二测序引物序列下游的下游特异性靶序列引物,所述下游特异性靶序列引物的引物长度不超过30nt,所述下游特异性靶序列引物与第二测序引物序列之间设有由5~10个随机碱基构成的第二随机碱基序列,每一个随机碱基均选自A、C、G和T中的任意一个。 |
地址 |
518000 广东省深圳市南山区科技园讯美科技大厦2栋910 |