一种多功能抗微生物肽的最优多标记集成预测方法

摘要

本发明属于生物信息学领域，涉及一种多功能抗微生物肽的最优多标记集成预测方法。其步骤如下：基于抗微生物肽的氨基酸序列信息，采用伪氨基酸组成向量化方法，抽取抗微生物肽的多种不同维度的伪氨基酸组成特征向量；应用多标记分类算法在生成的所有不同维度的伪氨基酸组成特征向量上，训练出多个不同的多标记分类器；从所得的多标记分类器中，分别为抗微生物肽的每种功能类型筛选出最优多标记分类器子集；把待预测肽序列输入分类器子集中，执行加权多数投票融合策略，获得该肽序列的N种功能类型的归属。本发明不需要事先确定最优的特征参数组合，避免建模时通过大量遍历实验选取最优特征参数组合，既增加预测方法的实用性，又提高建模的效率。

主权项

一种多功能抗微生物肽的最优多标记集成预测方法，其特征在于：其步骤如下：(1)基于抗微生物肽的氨基酸序列信息，采用伪氨基酸组成向量化方法，依据不同的参数组合，抽取出抗微生物肽的多种不同维度的伪氨基酸组成特征向量；(2)应用多标记分类算法在步骤(1)生成的所有不同维度的伪氨基酸组成特征向量上，训练出多个不同的多标记分类器；(3)从步骤(2)中所得的所有多标记分类器中，利用遗传算法，分别为抗微生物肽的每种功能类型筛选出N组最优多标记分类器子集；(4)把待预测肽序列输入到步骤(3)筛选出的N组最优多标记分类器子集中，分别执行加权多数投票融合策略，获得该肽序列的N种功能类型的归属。