用邻接标签序列复制DNA用于基因组和表观基因组测序

摘要

本文提供了用于从模板多核苷酸精确测序和检测表观遗传信息的方法和设备。也提供了用于长片段链置换扩增多核苷酸的方法、具有用于多步处理的选择性可渗透屏障的微流体设备，和使用微流体设备进行多核苷酸扩增的方法。

主权项

一种用于对模板多核苷酸测序的方法，所述方法包括：(a)使所述模板多核苷酸与多个寡核苷酸对接触，其中每个寡核苷酸对的每个成员包括(i)接头序列，(ii)独特的标签序列，其与所述寡核苷酸对的另一成员上的互补序列杂交，并且其中所述寡核苷酸对中之一或两者包括(iii)与所述模板多核苷酸杂交的引物序列；(b)使所述模板多核苷酸和多个寡核苷酸对与缺乏链置换活性的聚合酶和对于聚合必要的试剂接触；和(c)使得多核苷酸链从所述引物序列的3’端延伸，以产生包括组分(i)‑(iii)和与所述模板多核苷酸互补的序列的延伸的多核苷酸；(d)收集所述延伸的多核苷酸；(e)对所述延伸的多核苷酸测序；和(f)基于独特的标签序列组装所述延伸的多核苷酸的序列，从而对所述模板多核苷酸测序，其中所述方法不包括使所述模板多核苷酸片段化或去除所述模板多核苷酸上的表观遗传标记物。