发明名称 一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法
摘要 本发明公开了一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法,包括以下步骤:步骤一、提取水稻种子或叶片中基因组DNA;步骤二、检测用通用引物、野生型(58-P)和突变型(58S-P)NFQ特异性探针的设计与合成,将引物稀释到36微摩尔,探针稀释到8微摩尔备用;步骤三、建立PCR体系、扩增与分析;步骤四、通过步骤三的分析结果,对水稻光敏不育基因pms3进行分型,计算水稻光敏不育基因pms3中突变型(58S-P)的纯度;本发明的方法能快速鉴别水稻pms3不育系,具有检测灵敏度高、特异型好、检测时间短,可在1-2小时内完成对pms3基因野生型和突变型的检测和分型。
申请公布号 CN105463072A 申请公布日期 2016.04.06
申请号 CN201510671494.0 申请日期 2015.10.13
申请人 安徽出入境检验检疫局检验检疫技术中心 发明人 宗凯;姚剑;周莉质;陈雪娇;李云飞;孙娟娟;余晓峰;郑海松;吕侠影;王满满
分类号 C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 合肥鼎途知识产权代理事务所(普通合伙) 34122 代理人 叶丹
主权项 一种水稻光敏不育基因pms3检测和分型方法,其特征在于:所述检测和分型方法包括以下步骤:步骤一、提取水稻种子或叶片中基因组DNA;步骤二、检测用通用引物、野生型(58‑P)和突变型(58S‑P)NFQ特异性探针:上游引物PGMS‑F:GGTGAAGCAAAGAAGTGCATTG下游引物PGMS‑R:CTGAACTGCGTGTTGATAAAAATTTT野生型58‑P探针:FAM‑TTGTGTACCATCCATCAAG‑NFQ突变型58S‑P探针:FAM‑TTGTCTACCATCCATCAAG‑NFQ将引物稀释到36微摩尔,探针稀释到8微摩尔备用;步骤三、建立PCR体系;所述建立PCR体系,荧光PCR反应体系由下列重量份的物质组成:<img file="FDA0000823745860000011.GIF" wi="1014" he="727" />步骤四、扩增与分析;所述扩增,PCR扩增条件为:95℃/1min,95℃/10sec,60℃/25sec,98℃10min,其中95℃/10sec至60℃/25sec过程进行50个循环;所述分析,通过数字PCR分析系统可以得出待检水稻中的光敏不育基因pms3中野生型(58‑P)和突变型(58S‑P)各自基因拷贝数,计算水稻光敏不育基因pms3中突变型(58S‑P)占比,即纯度。
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