发明名称 |
一种细小病毒高通量DNA测序的数据后分析方法 |
摘要 |
本发明属于在分子生物学技术领域,特别涉及染色质测序数据分析技术领域,具体是指一种细小病毒高通量DNA测序的数据后分析方法。其特征在于该方法根据用户需要,对细小病毒高通量测序数据后期进行高效的数据分析等操作,特别适用于多个样本组数据,从而能够减少数据分析人员的工作负担,降低数据处理的难度,且本发明的高通量测序数据后期处理方法的应用范围也较为广泛。 |
申请公布号 |
CN105320849A |
申请公布日期 |
2016.02.10 |
申请号 |
CN201410376284.4 |
申请日期 |
2014.08.03 |
申请人 |
晶能生物技术(上海)有限公司 |
发明人 |
张艺;梁建伟;何飞;熊玉宇 |
分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
主分类号 |
G06F19/22(2011.01)I |
代理机构 |
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代理人 |
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主权项 |
一种细小病毒高通量DNA测序的数据后分析方法,其特征在于,所述的方法包括以下步骤:(1) 获得细小病毒高通量测序数据的矩阵数据,对其进行尺寸变换,得到新的矩阵数据;(2) 给定预设的模拟格式高通量数据序列比对数据;(3) 对(1)中获取的新的矩阵文进行分位数规范化处理,形成统一的值域范围;(4) 根据指定的K值,从(3)中筛选出符合条件的数据;(5) 根据所述的新的矩阵文件、筛选后的数据和模拟格式高通量数据序列比对数据生成前景数据和背景数据,通过比较各信号值在前景数据和背景数据中的数量分布,得到前景信号假阳性概率;(6) 根据矩阵数据及预设的预期聚合酶链反应冗余片段在总样本中所占比例,生成聚合酶链反应冗余片段阈值并在所述的高通量测序数据中标记所述的聚合酶链反应冗余片段位置。 |
地址 |
201111 上海市闵行区元江路5500号第2幢1187室 |