短端粒丰度的量度

摘要

本发明提供了用于从具有预定长度范围内的端粒(例如最多为一定长度的短端粒)的样本中的染色体测量端粒丰度的方法和材料。所述方法可以涉及进行被校准以从不超过限定长度的双链染色体DNA模板产生延伸产物的限时延伸反应的第一步骤；和从所述延伸产物扩增以亚端粒序列和锚定序列为边界的序列，以产生限长的端粒序列产物的第二步骤。可以测量这种产物中的端粒序列的丰度，并且可以使所述量度与各种指标相关联。

主权项

一种制备核酸延伸产物的方法，其包括：i)使延伸引物与双链染色体DNA的3'突出中的端粒重复序列杂交，其中：(1)所述双链染色体DNA具有包含端粒重复序列的端粒区域和包含亚端粒序列的亚端粒区域；且(2)所述延伸引物包含：(A)3'部分，其在退火条件下与所述3'突出中的端粒重复序列杂交，和(B)具有锚定序列的5'部分，其在所述退火条件下不与所述3'突出中的端粒重复序列杂交；以及ii)进行限时延伸反应，以使所述延伸引物向所述双链染色体DNA的所述亚端粒区域延伸，其中所述延伸反应被定时为仅从具有在预定长度范围内的端粒区域的双链染色体DNA产生包含端粒重复序列和亚端粒序列的延伸产物。