胎儿性染色体的非侵入性产前基因分型

摘要

本发明提供了用于分析母本样品，从而确定孕妇的男性胎儿是否继承了母亲的X连锁突变的方法、仪器和系统。获得样品中胎儿DNA的百分率，并确定两种可能性（胎儿继承突变的等位基因或正常的等位基因）的截断值。然后，将X染色体上突变等位基因相对于正常等位基因的比例与截断值相比较，以作出继承了哪个等位基因的分类。备选地，可以将由X染色体上的目标区域得到的等位基因的数量与X染色体上的参照区域的等位基因的数量相比较，从而鉴别缺失或扩增。可以通过计数与胎儿特有的等位基因的反应，并校正数量以说明反应中的统计学分布来计算胎儿DNA的百分率。

主权项

一种用于确定孕妇的男性胎儿是否具有X连锁突变的系统，其中所述孕妇在所述X染色体的基因座处是突变等位基因和正常等位基因杂合的，所述系统包括：接收由多个反应得到的数据的装置，每个反应都涉及由生物学样品得到的一种或多种核酸分子，所述生物学样品包括由所述孕妇得到的以及由所述男性胎儿得到的核酸分子，其中所述数据包括：第一组定量数据，其表明所述基因座处的所述突变等位基因的第一量；以及第二组定量数据，其表明所述基因座处的所述正常等位基因的第二量；由所述第一量和所述第二量确定参数的装置，其中所述参数表示所述第一量和所述第二量之间的比值；获得所述生物学样品中胎儿核酸分子的百分率Pf的装置；计算用于确定所述胎儿在所述基因座处是否继承了所述突变等位基因的第一截断值的装置，其中所述第一截断值至少衍生自k/(1+k‑Pf)的第一比例，其中k为所述孕妇的突变染色体上的突变等位基因的数量，k为等于或大于1的整数；计算用于确定所述胎儿在所述基因座处是否继承了所述正常等位基因的第二截断值的装置，其中所述第二截断值至少衍生自[k(1‑Pf)]/[1+k‑kPf)]的第二比例；以及将所述参数与所述第一截断值和第二截断值中的至少一者相比较的装置，从而确定所述胎儿是继承了所述突变等位基因还是所述正常等位基因的分类。