发明名称 荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途
摘要 本发明公开了一种荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途;其结构式如式I所示:<img file="DDA0000752273310000011.GIF" wi="1719" he="320" />,其中,R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>不同时为H;m,n为0~10的整数。与现有技术相比,本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端;用变性PAGE胶即测序胶证明,该类可逆终端在模板为连续多个相同碱基时,一次只能延伸一个可逆终端,且延伸效率为100%,在还原剂作用下,可实现高效快递完全剪切,具有应用于DNA测序的巨大潜力和价值;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
申请公布号 CN105085591A 申请公布日期 2015.11.25
申请号 CN201510388164.0 申请日期 2015.07.03
申请人 上海交通大学 发明人 沈玉梅;谭连江;邵志峰;龚兵;杨晴来;李小卫
分类号 C07H19/10(2006.01)I;C07H19/20(2006.01)I;C07H1/00(2006.01)I;C07C245/08(2006.01)I;C09K11/06(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I 主分类号 C07H19/10(2006.01)I
代理机构 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人 郭国中;陈少凌
主权项 一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸,其结构式如式I所示:<img file="FDA0000752273280000011.GIF" wi="1699" he="340" />其中,碱基选自U(或T)、C、A、G四个不同的碱基;荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种;R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>选自H、C2~C14的烷基、羧基、羧酸酯、羟基、PEG链、醚,且R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>不同时为H;m为0~10中的任一整数,n为0~10中的任一整数。
地址 200240 上海市闵行区东川路800号