发明名称 |
荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途 |
摘要 |
本发明公开了一种荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途;其结构式如式I所示:<img file="DDA0000752273310000011.GIF" wi="1719" he="320" />,其中,R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>不同时为H;m,n为0~10的整数。与现有技术相比,本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端;用变性PAGE胶即测序胶证明,该类可逆终端在模板为连续多个相同碱基时,一次只能延伸一个可逆终端,且延伸效率为100%,在还原剂作用下,可实现高效快递完全剪切,具有应用于DNA测序的巨大潜力和价值;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。 |
申请公布号 |
CN105085591A |
申请公布日期 |
2015.11.25 |
申请号 |
CN201510388164.0 |
申请日期 |
2015.07.03 |
申请人 |
上海交通大学 |
发明人 |
沈玉梅;谭连江;邵志峰;龚兵;杨晴来;李小卫 |
分类号 |
C07H19/10(2006.01)I;C07H19/20(2006.01)I;C07H1/00(2006.01)I;C07C245/08(2006.01)I;C09K11/06(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C07H19/10(2006.01)I |
代理机构 |
上海汉声知识产权代理有限公司 31236 |
代理人 |
郭国中;陈少凌 |
主权项 |
一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸,其结构式如式I所示:<img file="FDA0000752273280000011.GIF" wi="1699" he="340" />其中,碱基选自U(或T)、C、A、G四个不同的碱基;荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种;R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>选自H、C2~C14的烷基、羧基、羧酸酯、羟基、PEG链、醚,且R<sub>1</sub>、R<sub>2</sub>、R<sub>3</sub>、R<sub>4</sub>、R<sub>5</sub>、R<sub>6</sub>不同时为H;m为0~10中的任一整数,n为0~10中的任一整数。 |
地址 |
200240 上海市闵行区东川路800号 |