发明名称 | 一种鉴别正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞的方法 | ||
摘要 | 本发明是一种用于鉴别正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞的方法。本方法用一组正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞的标志性小RNA的表达丰度值Ct减去18sRNA的表达丰度值所得的标准化表达丰度值ΔCt值作为标准数据,采用聚类分析软件Gene Cluster 3.0,分别输入标准数据和待测样本的标志性小RNA的ΔCt值,由显示的聚类分析图谱来作出判定,若彩色图谱显示该样本归入正常肝上皮细胞部分,说明其来源于正常肝上皮细胞;若显示该样本归入正常胆管上皮细胞部分,说明其来源于正常胆管上皮细胞;若显示既不归入正常肝上皮细胞部分,也不归入正常胆管上皮细胞部分,就说明该样本既非正常肝上皮细胞,也非正常胆管上皮细胞。本发明方法鉴别方便,准确率高。 | ||
申请公布号 | CN101407841A | 申请公布日期 | 2009.04.15 |
申请号 | CN200810203614.4 | 申请日期 | 2008.11.28 |
申请人 | 中国人民解放军第二军医大学 | 发明人 | 王红阳;陈磊;鄢和新;杨文 |
分类号 | C12Q1/68(2006.01)I | 主分类号 | C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 | 上海德昭知识产权代理有限公司 | 代理人 | 丁振英 |
主权项 | 1.一种鉴别正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞的方法,其特征在于用一组正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞的标志性小RNA的表达丰度值Ct减去18sRNA的表达丰度值所得的标准化表达丰度值ΔCt值作为标准数据,采用聚类分析软件Gene Cluster 3.0,分别输入标准数据和待测样本的相应标志性小RNA的ΔCt值,并进行如下设置:设定%present参数大于等于80,设定连锁方式为average linkage,由显示的聚类分析图谱,来判定其是否为正常肝上皮细胞或正常胆管上皮细胞,所说的标志性小RNA分别为mir-122、mir-320、mir-222、mir-194、mir-200c、mir-30e、mir-296、let-7g、mir-27b、mir-17-3p、mir-148a、mir-152、mir-139。 | ||
地址 | 200433上海市杨浦区翔殷路800号 |