多重基因组获得和丢失分析

摘要

本发明提供了一种针对染色体获得和丢失的编码小球多重分析，所述分析的益处是可将复杂的大型模板DNA来源(例如BAC DNA)作为探针材料，而没有小球交联或其他分析性能问题。本文描述了用于分析DNA的试剂，所述试剂含有连接有由模板DNA序列扩增得到的扩增子的多个编码颗粒。每个连接的扩增子均含有与模板DNA序列的一个随机部分相同的一段核酸序列，其中所述扩增子合在一起基本上代表完整的模板DNA，并且其中每个扩增子的与模板DNA序列的一个随机部分相同的核酸序列要比所述完整的模板DNA短。

主权项

一种分析DNA样本的方法，包括：提供包含连接有扩增子的编码颗粒的第一编码颗粒系列，所述扩增子均包含引物来源的DNA区段和合在一起基本上代表完整的第一种模板DNA序列的随机核酸序列，其中所述完整的模板DNA序列的长度范围是约20‑300kb，包括端值，并且各个连接的扩增子均含有与所述模板DNA序列的一个随机部分相同的一段DNA序列，其长度范围为约500–1200个核苷酸，包括端值；使所述第一编码颗粒系列的扩增子与可检测地标记的样本DNA杂交；使所述第一编码颗粒系列的扩增子与可检测地标记的参照DNA杂交；检测指示所述第一编码颗粒系列的扩增子与可检测地标记的样本DNA特异性杂交的第一信号，以及指示所述第一编码颗粒系列的扩增子与可检测地标记的参照DNA特异性杂交的第二信号；并且比较所述第一信号和所述第二信号，以检测所述第一信号和所述第二信号之间的差异，所述第一信号和第二信号之间的差异指示所述样本DNA和所述参照DNA之间的差异，由此分析所述DNA样本，所述方法用于非诊断目的。