发明名称 |
一种测试纯系油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法 |
摘要 |
本发明公开了一种测试纯系油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法。所述方法包括:获得变异位点;确定待测油菜品种的测试区域;构建数据库;确定抽样量后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备引物;利用引物对混合样本的DNA进行扩增,扩增产物用于构建高通量测序文库;对高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析测序片段组,获得待测油菜品种基因型和杂株基因型;比较获得近似品种、变异位点和变异位点率;将杂株基因型与数据库中的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用变异位点、变异位点率和杂株率,判断待测油菜品种特异性、一致性和稳定性。该方法能够准确、完整地判断待测油菜品种的特异性、稳定性与一致性。 |
申请公布号 |
CN104846077A |
申请公布日期 |
2015.08.19 |
申请号 |
CN201510148702.9 |
申请日期 |
2015.03.31 |
申请人 |
江汉大学;中国农业科学院作物科学研究所 |
发明人 |
张静;彭海;陈斌;陈红霖;王沁 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
北京三高永信知识产权代理有限责任公司 11138 |
代理人 |
徐立 |
主权项 |
一种测试纯系油菜新品种的特异性、一致性与稳定性的方法,其特征在于,所述方法包括:获得不同油菜品种间的变异位点;通过所述变异位点确定待测油菜品种的测试区域,所述测试区域包括通用测试区域,至少部分所述变异位点包含在所述通用测试区域内;构建包含所述不同油菜品种在所有所述测试区域的基因型的数据库;确定所述待测油菜品种的抽样量SN后,随机抽样混合并提取混合样本的DNA;制备扩增所述测试区域的引物,所述引物包括所述通用测试区域引物;利用所述引物对所述混合样本的DNA进行扩增,得到所述测试区域的扩增产物,所述扩增产物用于构建高通量测序文库;对所述高通量测序文库进行高通量测序,得到测序片段组;分析所述测序片段组,获得待测油菜品种基因型和杂株基因型;将所述待测油菜品种基因型与所述数据库中的所述不同品种的基因型比较,获得所述待测油菜品种的近似品种、变异位点和变异位点率;将所述杂株基因型与所述数据库中的所述不同品种的基因型比较,获得杂株品种后,计算杂株率;利用所述变异位点、所述变异位点率和所述杂株率,判断所述待测油菜品种的特异性、一致性和稳定性。 |
地址 |
430056 湖北省武汉市沌口经济技术开发区新江大路8号江汉大学 |