发明名称 |
一种虾夷扇贝生长性状相关的SNP位点及其检测和应用 |
摘要 |
本发明提供一种与虾夷扇贝生长性状相关的SNP位点,所述的位点为核苷酸序列为SEQ ID NO:2的IGFBP基因的1054位,其碱基为A或G;本发明还提供用于检测上述SNP位点的探针及分型引物。本发明通过对虾夷扇贝中IGFBP基因的转录序列进行测序和Clustal比对,筛查到3个SNP位点。运用高分辨率熔解曲线技术在虾夷扇贝群体中检测位点多态性,并分析位点基因型频率与扇贝生产性状间的相关性。位点C.1054A>G与虾夷扇贝壳高、壳长、体重、软体重和闭壳肌重等重要生长性状显著相关,AG型个体的上述生长性状均显著低于AA和GG型个体(P<0.05),且GG型的性状值最高。因此,在生产中可优先选择在该位点基因型为GG型的个体,作为高产扇贝选育的亲本或者进行规模养殖。 |
申请公布号 |
CN103740729B |
申请公布日期 |
2015.07.08 |
申请号 |
CN201410035028.9 |
申请日期 |
2014.01.25 |
申请人 |
中国海洋大学 |
发明人 |
包振民;胡晓丽;封利颖;于茜;李雪;张玲玲;王师;邹佳君 |
分类号 |
C12N15/12(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;A01K61/00(2006.01)I |
主分类号 |
C12N15/12(2006.01)I |
代理机构 |
青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 |
代理人 |
曾庆国 |
主权项 |
一种用于检测与虾夷扇贝生长性状相关的SNP位点的探针及分型引物,其特征在于,所述的探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:3,引物的序列分别为SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5;其中所述的SNP位点为核苷酸序列为SEQ ID NO:2的IGFBP基因的1054位,其碱基为A或G。 |
地址 |
266003 山东省青岛市市南区鱼山路5号 |