发明名称 |
番茄抗白粉病基因快速鉴定 |
摘要 |
本发明是快速鉴定番茄抗白粉病基因;涉及到植物比较基因组学,遗传学和生物信息学等学科知识,属于植物生物技术科学领域。该发明主要步骤为:1)番茄全基因组序列的下载及MLO型基因的采集;2)MLO型基因的鉴定;3)MLO型基因系统发育关系;4)MLO型白粉病基因的比对。该发明有效的缩短了番茄白粉病基因挖掘周期,有利于白粉病基因的快速鉴定;通过鉴定的候选白粉病基因开发相应的共分离功能性标记(SNP、SCAR等),还可以快速的用于抗白粉病基因的分子标记辅助选择,准确性高;结合其它抗病基因分子标记可进行多抗性育种材料的创制,缩短育种年限,提高育种效率;为阐述番茄抗白粉病分子机制奠定了基础。 |
申请公布号 |
CN104593479A |
申请公布日期 |
2015.05.06 |
申请号 |
CN201310524702.5 |
申请日期 |
2013.10.30 |
申请人 |
江苏省常熟现代农业产业园区发展有限公司 |
发明人 |
钱春桃;其他发明人请求不公开姓名 |
分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I;G06F19/24(2011.01)I;C12N15/29(2006.01)I;C07K14/415(2006.01)I |
主分类号 |
C12Q1/68(2006.01)I |
代理机构 |
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代理人 |
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主权项 |
番茄抗白粉病基因,其特征在于选自下列5个基因或其之一: 1.Solyc02g077570.1.1 氨基酸: MAGSNNSRVITLVTTPTWAIAVVCFILITISILIEHVLHLLAKMLLGFISLLLNVLQKPIAKICIPKGAAQTFLPCQSFTTDDVEEESNCEQQGKKSLMSRAASAFNICSCFLSYSFLHPHLQPWNTWKFWEAETTTLDYQFSHDPRRFQLIHQTSFGKRHLNFWSEHRFLRFPVCLLRQFYGSVYKVDYLTLRHGFIMAHFAEGTEFDFHKYIRRALDKDFQVVVAISPWIWTFSMLFIFFNANVFHSTYWLPFIPLAMLVAVGTKLQGIITKMCLDSNYKSSVIRGNLVVKPEDQFFWFGKPKLLLLLMHFILFQNSFQLAFFAWTTVSVMILCYLYKLLNPLDIYELKIELTYQILFQQISNLISILNKILN 核苷酸: ATGGCAGGTTCAAACAACAGTAGAGTCATAACTCTTGTGACAACACCAACATGGGCTATTGCTGTTGTGTGTTTCATTTTAATTACTATTTCCATTCTTATAGAACATGTCCTTCATCTCTTAGCTAAGATGCTTTTGGGATTTATCTCTTTATTGCTGAATGTTCTCCAAAAGCCTATTGCCAAAATTTGTATTCCAAAGGGTGCTGCTCAGACTTTTCTTCCTTGCCAAAGCTTCACAACTGATGATGTTGAGGAGGAGTCAAACTGTGAACAACAGGGAAAGAAATCTTTAATGTCAAGAGCAGCTTCAGCTTTTAATATTTGCTCTTGCTTTCTTTCATATTCTTTCTTGCATCCTCACCTTCAGCCTTGGAACACATGGAAATTTTGGGAGGCAGAAACAACAACCTTAGATTATCAATTTTCACATGATCCAAGGAGGTTTCAACTAATTCATCAAACATCATTCGGAAAGAGGCATCTCAATTTTTGGAGTGAACACCGCTTTCTACGTTTCCCAGTTTGTTTGTTGAGGCAATTTTATGGATCAGTATATAAAGTAGACTACTTAACTCTCCGGCATGGATTCATAATGGCACATTTTGCTGAAGGAACAGAGTTTGATTTTCACAAGTATATAAGAAGAGCTTTAGATAAAGATTTTCAAGTTGTCGTGGCAATTAGCCCATGGATTTGGACCTTTTCTATGCTCTTCATATTCTTCAATGCAAATGTGTTCCATAGCACCTATTGGCTTCCTTTCATTCCTCTAGCGATGTTAGTGGCTGTTGGAACAAAATTACAAGGCATAATCACAAAAATGTGTTTGGATAGCAATTATAAGTCAAGTGTTATTAGAGGAAATTTAGTGGTTAAACCTGAAGATCAATTCTTTTGGTTTGGAAAACCCAAACTTCTTCTTCTTCTCATGCATTTCATCCTCTTTCAGAACTCGTTTCAGTTGGCATTTTTTGCATGGACAACGGTAAGCGTTATGATTTTATGTTATTTATATAAGCTATTGAATCCCCTTGATATATATGAATTGAAGATCGAACTTACTTATCAAATATTATTTCAACAAATATCAAACTTAATTAGCATTTTAAATAAGATTCTTAACTAA 2.Solyc06g010030.2.1 氨基酸: MAGGGGGGRSLEQTPTWAVAVVCFVLVAISIVIEHIIHLIGKWLKSKNKSALYEALEKIKAELMLLGFISLLLTVGQSPISNICVSEKLGNSWHPCSKKEEDSSIISEDSLSEQHRRRLLMDAAGGGVRRILAGGGGDDKCAAKGKVPFVSADGIHQLHIFIFVLAVFHVLYCVTTLALGRAKMRSWKSWENETKTAEYEFSHDPERFRFTRETSFGRRHLSFWTKNPVLLWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFITAHLAPQSHQKFDFRKYIKRSLEEDFKVVVGISPPIWFLAVLFLLFNTHGWYSYLWLPFIPLIVILLVGTKLQVIITKMGLRIHERGEVVKGVPVVQPGDHLFWFNRPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWTWYEFGLKSCYHDHTEDIVIRITMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSNMKSTIFNERVATALKNWHHTAKKHVKDQSKHSNPVTPMSSRPGTPSHHGMSPVHLLRGHYRSDMGSLQNSPRRSNYDFDHWDNEGSPSPSRFYQEAVDGSLHHIQLGQLDHELQQVIEPNSSQVVPLSQEGRDQHEITIAGSRDFSFEKRTTSI 核苷酸: ATGGCCGGTGGTGGTGGTGGTGGAAGATCGTTGGAGCAAACGCCAACTTGGGCGGTTGCCGTTGTTTGTTTTGTGTTAGTTGCAATATCTATTGTCATTGAACATATTATCCACCTTATTGGAAAGTGGTTGAAGTCTAAAAATAAAAGTGCCTTGTATGAAGCACTTGAAAAGATCAAAGCAGAGCTTATGCTGCTGGGATTCATATCATTGTTGTTAACAGTAGGACAAAGTCCAATTTCGAACATATGTGTATCAGAAAAATTAGGAAATTCATGGCATCCATGTAGTAAAAAAGAAGAAGATAGTAGTATAATTTCAGAAGATTCGTTGTCGGAGCAACACCGCCGGAGACTTCTTATGGATGCTGCCGGCGGTGGCGTACGACGAATATTGGCTGGTGGTGGTGGAGATGACAAATGTGCAGCAAAGGGAAAAGTACCATTTGTGTCTGCTGATGGAATTCATCAATTACACATTTTCATCTTTGTGCTGGCTGTATTTCATGTCCTCTATTGTGTTACAACTTTGGCTTTGGGGAGAGCTAAGATGAGAAGTTGGAAGTCATGGGAAAATGAAACTAAAACAGCTGAATACGAATTCTCTCACGATCCTGAAAGATTTCGATTTACAAGAGAAACATCATTTGGAAGAAGACACTTGAGCTTTTGGACCAAAAATCCTGTCCTACTTTGGATCGTTTGTTTCTTTAGGCAATTTGTAAGATCTGTCCCAAAAGTTGATTACTTAACACTTAGGCATGGATT TATTACGGCACATTTAGCACCACAGAGCCACCAAAAATTTGATTTCCGAAAGTACATTAAACGATCACTTGAAGAAGATTTTAAAGTGGTTGTAGGAATCAGTCCCCCAATATGGTTCCTCGCCGTGCTCTTCTTACTCTTTAATACTCATGGCTGGTATTCCTATCTTTGGCTACCATTCATCCCCTTGATTGTGATATTATTAGTAGGGACAAAGCTACAAGTGATAATAACAAAAATGGGGCTAAGGATTCATGAAAGAGGAGAAGTAGTAAAAGGGGTACCTGTGGTTCAGCCAGGAGATCACCTTTTTTGGTTCAACCGTCCTCGTCTCATTCTTTATCTTATTAACTTTGTTCTCTTTCAGAATGCTTTTCAGTTGGCCTTCTTTGCTTGGACTTGGTATGAATTTGGGTTGAAATCTTGTTACCATGACCATACTGAGGATATTGTCATCAGAATTACTATGGGGGTCCTCATTCAGATTCTGTGCAGTTATGTCACTCTTCCTCTTTATGCCCTTGTGACACAGATGGGTTCAAACATGAAATCAACTATCTTCAATGAAAGAGTAGCAACAGCATTGAAGAATTGGCACCACACAGCAAAGAAACATGTAAAGGATCAAAGCAAACATTCTAATCCAGTGACACCAATGTCAAGTAGACCAGGGACACCTTCTCATCATGGCATGTCACCCGTGCATTTATTGCGCGGACATTATAGGAGTGATATGGGCAGTCTACAAAACTCACCTCGTAGATCAAACTACGATTTTGATCATTGGGACAACGAGGGCTCACCTTCACCCTCCCGGTTTTACCAGGAGGCTGTTGATGGCTCATTGCACCATATTCAACTTGGTCAATTGGACCATGAACTGCAACAAGTTATTGAGCCTAATTCGTCACAAGTGGTTCCTCTATCACAAGAGGGTCGCGACCAACATGAGATTACTATTGCTGGATCAAGAGATTTTTCGTTTGAGAAAAGAACAACCAG TATATAG。 3.Solyc11g069220.1.1 氨基酸: MAGGGGGRSLEQTPTWAVALVCFALVAISIVIELIIHLIGKWLKSKHKRALYEALEKIKAVGQDPISNICVSEKIASTWHPCSKQKEAEMNKYISGDLEGHRRRLFTADDGGVRRVLAAAGTDKCADKGKVAFVSADGIHQLHIFIFVLAIFHVFYCVTTLALGRAKMSRWKIWEKETRTAEYQFSHDPERFRFARDTSFGRRHLSFWTKNSVLLWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFITSTNLVPCWYSYLWLPFIPLLVILLVGTKLQVIITKMGLRIQERGEVVKGVPVVQPGDDLFWFNRPRLLLFLINFVLFQNAFQLAFFAWTWYEFGLKSCFHDQTEDIVIRMTMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNERVAMALRKWHHSAKKHIKEINKQHSNPTTPMSSRPPTPSHGMSPVHLLRGIRTSDMDVGPRRSSYNNIDHWDIEGSPSPNRHDSEVHEPNLSEIEAREQYEINIARSRDFSFDKRTTSV 核苷酸: ATGGCGGGAGGAGGAGGAGGAAGATCGTTGGAGCAAACGCCGACGTGGGCGGTTGCCCTAGTTTGTTTTGCATTGGTTGCCATTTCCATTGTAATAGAGCTCATCATCCATCTTATTGGCAAGTGGTTGAAGTCTAAACATAAAAGAGCATTATATGAAGCACTTGAGAAGATAAAAGCAGTAGG GCAAGATCCAATTTCAAATATTTGTGTATCTGAAAAAATTGCAAGTACGTGGCATCCATGTAGTAAACAAAAAGAAGCTGAAATGAACAAATATATTTCCGGTGACTTAGAGGGTCATCGCCGGCGACTTTTCACGGCTGACGATGGCGGAGTCCGGCGAGTTTTGGCGGCTGCCGGAACTGACAAATGTGCAGACAAGGGAAAAGTAGCATTTGTGTCTGCTGATGGTATTCATCAATTACATATTTTCATTTTTGTGCTGGCTATTTTTCATGTATTTTATTGTGTTACCACATTGGCATTGGGAAGAGCTAAGATGAGTCGTTGGAAGATATGGGAAAAGGAAACAAGAACAGCTGAGTACCAATTTTCTCATGATCCAGAGAGATTTCGATTTGCTAGAGATACATCATTTGGAAGAAGACATTTGAGTTTTTGGACTAAAAATTCAGTTCTTCTATGGATTGTTTGTTTCTTCAGGCAATTTGTAAGATCTGTTCCAAAAGTTGATTATTTGACCCTACGACATGGTTTTATCACGTCCACCAATTTGGTTCCTTGCTGGTATTCTTATCTGTGGCTACCGTTCATTCCGTTACTTGTGATATTATTAGTAGGGACTAAACTACAAGTGATTATAACAAAAATGGGATTAAGAATTCAAGAAAGGGGAGAAGTAGTGAAAGGGGTACCTGTGGTTCAACCTGGAGATGATTTATTTTGGTTTAATCGTCCTCGTCTACTACTTTTTTTAATTAATTTTGTTCTTTTTCAGAATGCTTTTCAATTGGCTTTCTTTGCTTGGACTTGGTATGAATTTGGGCTGAAATCTTGTTTCCATGACCAAACTGAGGACATCGTAATTAGAATGACAATGGGGGTTCTTATTCAGATTCTTTGCAGCTATGTTACTCTTCCATTATATGCTCTTGTAACACAGATGGGATCAACAATGAAACCAACAATCTTCAATGAAAGAGTAGCAATGGCATTGAGAAAATGGCACCATAGTGCCAAAAAACACATCAAAGAGATCAACAAGCAACACTCAAATCCAACAACACCAATGTCAAGTAGGCCACCAACTCCCTCTCACGGCATGTCACCCGTCCATCTCCTACGCGGTATCAGGACGAGTGACATGGACGTGGGTCCACGAAGATCGAGTTATAATAATATAGACCATTGGGATATTGAGGGCTCACCATCTCCAAATCGTCACGACTCTGAAGTTCACGAGCCTAATTTGTCAGAAATTGAGGCTCGTGAACAATACGAGATTAATATTGCTCGTTCAAGGGATTTTTCTTTTGATAAAAGAACGACTAGTGTATAA 4.Solyco3g095650.2.1 氨基酸: MASTGCIRTCDERPLDETPTWAVAMVCFVLVVISLFIEQLIHHLGEWLWKKQKRPLYEALEKIKSELMLLGFISLFLTVVQDPMSKICIPRSVGRSWHPCDINKHIDDQYLDPCRIKGKLQFASKYAIHQLHIFIFVLAVAHVLYCITTLGIGKLRMRTWRAWEDESKTIEYQFYNDPERFRFARETSFGRKHLHFWSNSPILLWIVCFFRQFYASVEKVDYLTLRHGFAMAHLAPQQEKNFDFQLYINRALEEDFKDVVGISPLLWMFAVLYFLTTTNGWYSYYWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITKMGLRIKERGDIVKGTPLVEPGDDLFWFNRPDLLHFFIHFVLFQNAYQLAFFAWSWWKFNLPSCFHKNVTDIAITLSMGALIQVLCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPVIFGDNAAYA IRTWHQTAKQRAKDGRPSKNASPVRSRAVSPLRGGSSPVQQKHGQLYPPSPNPSRRRSGGNPESSSRQIFDDGSHEQSEIEITLNDLSLENKLS 核苷酸: ATGGCTAGCACAGGCTGTATTAGAACGTGTGATGAACGTCCTCTAGATGAGACACCAACATGGGCTGTAGCCATGGTTTGCTTTGTATTAGTTGTAATCTCCCTTTTCATTGAACAACTTATTCATCATCTTGGAGAGTGGTTATGGAAGAAACAAAAGAGACCATTGTATGAAGCACTTGAGAAGATCAAGTCAGAACTCATGTTATTAGGGTTTATATCCTTATTCTTGACGGTTGTACAGGATCCTATGTCTAAGATATGTATTCCTAGGAGTGTTGGACGCTCTTGGCATCCATGTGACATAAACAAACATATTGATGACCAATATCTCGATCCATGTAGAATTAAGGGGAAACTCCAATTTGCTTCAAAATATGCAATTCACCAACTCCACATTTTTATCTTTGTGTTAGCCGTTGCACATGTGTTGTATTGTATTACCACTTTGGGAATTGGCAAACTAAGGATGAGGACATGGAGAGCTTGGGAGGATGAATCTAAAACAATTGAATACCAATTCTATAACGATCCTGAGAGATTTAGATTTGCAAGAGAAACATCATTTGGACGTAAACATTTGCATTTCTGGAGCAACTCTCCAATTCTTCTCTGGATAGTTTGTTTCTTCAGACAGTTCTATGCATCAGTTGAAAAAGTAGACTATCTTACCCTTAGACATGGCTTTGCTATGGCACATTTAGCACCTCAGCAAGAAAAGAATTTTGATTTTCAATTGTATATAAATAGAGCACTTGAAGAAGATTTTAAAGATGTTGTGGGAATAAGTCCACTGTTATGGAT GTTTGCAGTCCTCTACTTTCTCACTACTACCAATGGTTGGTATTCATACTATTGGCTGCCGTTCATTCCTTTAATTATAATATTACTGGTGGGCACAAAATTACAAGTGATTATAACAAAAATGGGATTAAGGATTAAAGAAAGAGGAGACATTGTTAAAGGAACACCATTAGTTGAACCAGGGGATGATCTTTTCTGGTTTAATCGTCCTGATCTTTTGCACTTCTTCATTCACTTTGTTCTCTTTCAGAATGCATATCAACTTGCTTTCTTTGCTTGGAGCTGGTGGAAATTTAATTTACCATCTTGCTTCCACAAAAATGTAACAGACATAGCCATAACACTTTCCATGGGGGCTCTCATTCAAGTTCTTTGCAGCTACGTGACACTCCCCCTATATGCCTTAGTTACTCAGATGGGATCAACAATGAAACCAGTTATCTTTGGTGACAACGTGGCATACGCGATACGGACATGGCATCAGACAGCAAAGCAACGGGCAAAAGACGGGCGTCCGTCGAAAAATGCGAGTCCAGTGAGAAGCAGGGCAGTGTCACCATTGCGTGGAGGTTCCTCTCCGGTTCAACAAAAACACGGGCAATTATATCCTCCATCACCTAATCCTTCGCGTAGGAGGAGTGGAGGTAATCCAGAATCGAGTTCTAGGCAAATCTTTGATGATGGAAGTCATGAGCAATCTGAAATTGAAATTACCTTGAATGATTTATCACTTGAAAACAAATTAAGTTGA 5.Solyco4g049090.2.1 氨基酸: MEATPTWAIAVVCFILLAISIFIEQIIHHIGEWLLEKRKKSLYEALEKIKAELMLLGFLSLLLTVLQDPVSNLCVPKSVGYSWHPCMAKEDAKSEYDDPCLPKGKVQFASSYAIHQLHIFIFVLAVAHVLYCIATFALGRLKMRKWRAWEDETKTMEYQFYNDPERFRFARETSFGRRHLHFWSKSPVLLSIVCFFRQFFSSVAKVDYLTLRHGFMMAHLTPQNQNNFDFQLYINRAVDKDFKVVVGISPALWLFTVLYFLTTTDRLYSYLWVPFIPLVIILLVGTKLQMIITEMGVRISERGDIVKGVPVVETGDHLFWFNRPALVLFLINFVLFQNAFQVAFFFWSWWKFGFPSCFHKNAADLAIRLTMGVIIQVHCSYVTLPLYALVTQMGSSMKPIIFGDNVATALRSWHHTAKKRVKHGLSGHTTPANSRPTTPLRGTSPVHLLRGYPQYNEDSVQASPRTSNVENEGWANENQEGEILQHASTDHNKQIEITMSDFTFGNK* 核苷酸: GACTTATTGTTTGAAACTTGCAACTACAATTCTTCTTTATCATCATTTGACATTTCCCCTTCTTCTTATTCCTATTTTTATTTAAATATAGGAATATTTCTTTCAAAGGAAGAAAATATATATTTCCTTCAACACCACTATATATAGACTTAATTCCATAATCCTGTTAATTTAATTGATGGCTAAAGAACGGTCTATGGAGGCAACCCCTACGTGGGCAATTGCTGTGGTTTGCTTCATCTTGCTCGCTATTTCTATTTTTATTGAACAAATTATTCATCACATTGGAGAGTGGTTACTGGAAAAGCGGAAAAAGTCTCTATATGAAGCACTTGAAAAGATCAAAGCTGAACTTATGCTGTTGGGATTCTTATCACTGTTGTTGACAGTGTTGCAAGATCCAGTTTCTAACTTATGTGTCCCCAAGAGTGTTGGTTATTCATGGCATCCTTGTATGGCAAAGGAAGATGCCAAGTCTGAGTATGATGACCCTTGTCTACCAAAGGGAAAAGTGCAATTTGCATCTTCATATGCAATACACCAGCTCCATATCTTCATCTTTGTATTGGCAGTTGCTCATGTATTGTACTGTATAGCAACTTTTGCTTTGGGCAGGCTAAAGATGAGAAAATGGAGGGCATGGGAGGATGAAACAAAAACAATGGAGTACCAATTCTACAACGACCCTGAGAGATTCAGATTTGCAAGGGAGACCTCGTTTGGACGTAGGCATTTGCATTTCTGGAGCAAGTCCCCCGTGTTGCTCTCGATAGTTTGTTTCTTTCGGCAATTCTTCTCATCAGTTGCAAAAGTTGACTATTTAACCCTTAGACATGGGTTCATGATGGCACATTTAACTCCACAAAATCAAAATAATTTTGATTTTCAATTATACATTAACAGAGCAGTTGACAAAGACTTCAAAGTTGTTGTTGGAATAAGTCCTGCATTATGGCTCTTCACGGTGCTATATTTTCTGACTACTACCGATCGATTGTACTCGTATCTTTGGGTGCCATTTATCCCACTTGTAATAATATTGCTAGTTGGCACAAAACTTCAAATGATCATAACAGAAATGGGAGTAAGGATTTCAGAAAGGGGAGACATAGTAAAAGGTGTACCTGTGGTGGAGACTGGTGACCATCTTTTCTGGTTTAATCGCCCTGCCCTTGTCCTATTCTTGATTAACTTTGTACTCTTTCAGAATGCGTTTCAAGTTGCTTTCTTTTTTTGGAGTTGGTGGAAATTTGGTTTCCCATCTTGCTTTCATAAGAATGCTGCAGACCTAGCCATAAGGCTAACCATGGGGGTGATCATACAGGTCCATTGCAGCTATGTGACTCTCCCTCTTTATGCCTTAGTTACACAGATGGGTTCATCAATGAAGCCTATCATCTTTGGTGATAATGTGGCAACAGCTCTTAGAAGCTGGCACCATACAGCGAAAAAACGGGTGAAACATGGGCTATCAGGACATACCACCCCTGCAAACAGCAGACCAACCACACCATTGCGTGGTACCTCCCCTGTTCACTTATTACGCGGTTATCCACAATATAATGAGGACAGTGTTCAAGCATCTCCTCGGACATCCAATGTCGAA AATGAAGGGTGGGCTAATGAAAATCAGGAGGGAGAGATCCTGCAGCATGCCTCCACTGATCATAACAAGCAAATTGAGATTACAATGTCAGATTTTACTTTTGGAAACAAATAAATGTAAAAACGAATTTTCTTCTTCATTGTTTTAAGTTCATTACTGTAGTTCAAATGGCAATGATTTTGTAAAATTTTATACAGAGGTACTCATGCATGGTGCTCTTCATTTCAAGGTAAGAACCTTCTTATATCGATTTATAGCTACTTTACATCTCA 。 |
地址 |
215534 江苏省常熟市董浜镇曹家桥市场 |