发明名称 一种检测上皮性卵巢癌的基因探针组合物及试剂盒
摘要 本发明涉及一种检测上皮性卵巢癌的基因探针组合物及试剂盒,该基因探针组合物包括c-myc基因探针,Rb1基因探针,Chk2基因探针,p53基因探针和BRCA1基因探针。本发明的另一目的是提供了一种上皮性卵巢癌荧光原位杂交检测试剂盒,该试剂盒包括上述基因探针组合物。本发明试剂盒可对同一样本甚至上皮性卵巢癌单个肿瘤细胞进行5基因的同时检测,显著提高了检测能力和效率。本发明另提供了一种为卵巢癌FISH研究提供了最佳的标本选择策略及制片方法。
申请公布号 CN103276060B 申请公布日期 2014.12.17
申请号 CN201310155757.3 申请日期 2013.04.28
申请人 中国医学科学院血液病医院(血液学研究所);天津医科大学附属肿瘤医院 发明人 程涛;黄宇婷;胡林萍;郝权
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12N15/11(2006.01)I;C12N15/10(2006.01)I 主分类号 C12Q1/68(2006.01)I
代理机构 天津滨海科纬知识产权代理有限公司 12211 代理人 韩敏
主权项 一种检测上皮性卵巢癌的基因探针组合物,其特征在于:该基因探针组合物由c‑myc基因探针,Rb1基因探针,Chk2基因探针,p53基因探针和BRCA1基因探针组成,上述基因探针均为经过荧光素标记的探针;所述基因探针组合物是由以下方法制备的:1)、克隆筛选:检索UCSC genome browser,NCBI Clone Registry,Ensembl Genome Browser数据库分别含有c‑myc、Rb1、Chk2、p53、BRCA1基因的所有细菌人工染色体克隆,并对这些克隆进行筛选,选出最佳的克隆; 2)、克隆培养和鉴定:按照筛选确定的克隆编号购买美国Invitrogen公司的BAC克隆,取5‑10微升克隆菌液加到3‑5毫升含氯霉素抗性的LB液体培养基中,37℃振摇活化培养8‑16小时;然后将菌液全部加入至400‑500毫升含氯霉素抗性的LB液体培养基中,37℃震摇培养8‑16小时;对c‑myc、Rb1、Chk2、p53、BRCA1的BAC克隆用相对应的基因引物进行多聚酶链式反应扩增,用1‑2%的琼脂糖凝胶电泳对产物进行分析,从而完成待选克隆的分子鉴定; 3)、基因探针的制备和鉴定:获得目的基因的克隆后,提取大量DNA,酶切DNA后采用缺口平移的方法对酶切后的DNA进行荧光素标记,再对c‑myc,Rb1,Chk2,p53和BRCA1基因探针组合后进行沉淀和浓缩,将制作好的探针组合物溶解到含有50%去离子甲酰胺的杂交缓冲液中,即得荧光标记探针组杂交混合液,采用正常人外周血单个核细胞甩片进行探针鉴定;上述1)、克隆筛选步骤针对c‑myc、Rb1、Chk2、p53、BRCA1基因选出的最佳克隆分别为: c‑myc基因:RP11‑440N18, 来自UCSC genome browser; Rb1基因:RP11‑305D15,来自UCSC genome browser; Chk2基因:RP11‑73I4,来自UCSC genome browser; p53基因:RP11‑1081A10,来自UCSC genome browser; BRCA1基因:RP11‑831F13,来自UCSC genome browser;上述2)、克隆培养和鉴定步骤中对c‑myc、Rb1、Chk2、p53、BRCA1的BAC克隆相对应的基因引物序列为: c‑myc基因探针:上游引物:TACTGCGACGAGGAGGAGAA(SEQ ID NO:1) 下游引物:CGAAGGGAGAAGGGTGTGAC(SEQ ID NO:2) Rb1基因探针:上游引物:TGCAGTATGCTTCCACCAGG(SEQ ID NO:3) 下游引物:TGTTGGTGTTGGCAGACCTT(SEQ ID NO:4) Chk2基因探针:上游引物:ATTTTGTCAGGGCCAACATACTG(SEQ ID NO:5) 下游引物:CCCATCGCCTCTTAGGTAAATTC(SEQ ID NO:6) P53基因探针:上游引物:GAACAGCTTTGAGGTGCGTG(SEQ ID NO:7) 下游引物:CTTCTTTGGCTGGGGAGAGG(SEQ ID NO:8) BRCA1基因探针:上游引物:TAGGGCTGGAAGCACAGAGT(SEQ ID NO:9) 下游引物:AATTTCCTCCCCAATGTTCC(SEQ ID NO:10)。
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