发明名称 微生物聚集体定量显微成像测定及评价方法
摘要 本发明公开了一种微生物聚集体性能的定量显微成像测定及评价方法,其特征是:首先标定待测微生物聚集体样本的灰度值与比重值标准关系曲线;然后利用数码显微镜获取由含有待测微生物聚集体的混合液制成的待测玻片的图像,由图像中所有微生物聚集体的分辨率、R值、G值和B值,计算所有待测微生物聚集体的灰度值和面积,并由灰度值以及灰度值和比重值标准关系曲线计算其比重值;最后采用模糊模式识别方法,对待测微生物聚集体的面积和比重值进行综合评价,获得级别特征值向量作为待测微生物聚集体的评价结果。本发明以一种高效、准确的方法实现了对微生物聚集体的定量分析和综合评价。
申请公布号 CN103234865B 申请公布日期 2014.12.03
申请号 CN201310156922.7 申请日期 2013.05.02
申请人 合肥工业大学 发明人 陈国炜;汤泽兵;刘欢;梁腾方;祝宁;刘丽;胡真虎
分类号 G01N9/24(2006.01)I 主分类号 G01N9/24(2006.01)I
代理机构 安徽省合肥新安专利代理有限责任公司 34101 代理人 何梅生
主权项 微生物聚集体定量显微成像测定及评价方法,其特征是按如下步骤进行:a、按如下步骤标定待测微生物聚集体样本的灰度值与比重值标准关系曲线:a1、以1.0°Bx为糖度梯度,取糖度从5.0°Bx到21.0°Bx的蔗糖水溶液共17组,标记为蔗糖水溶液m,m=1,2,…,17;a2、从待测微生物聚集体样本中取含有微生物聚集体的混合液,测试所述混合液的质量浓度值,记为p,以蒸馏水作为溶剂将所述混合液稀释到质量浓度值为p/100,获得待标定混合液样本;a3、使用胶头吸管从待标定混合液样本中吸取一个微生物聚集体,将所述微生物聚集体无初速滴入蔗糖水溶液1中,静置30秒;若所述微生物聚集体在所述蔗糖水溶液1中悬浮,则将蔗糖水溶液1的糖度标记为所述微生物聚集体的比重值,否则,将其取出并无初速滴入蔗糖水溶液2中,静置30秒,若所述微生物聚集体在所述蔗糖水溶液2中悬浮,则将蔗糖水溶液2的糖度标记为所述微生物聚集体的比重值,否则,将其取出并无初速滴入蔗糖水溶液3中,静置30秒,……以此类推,直到所述微生物聚集体在蔗糖水溶液m中悬浮,将蔗糖水溶液m的糖度标记为所述微生物聚集体的比重值;a4、将所述微生物聚集体取出,置于蒸馏水中清洗两次,得到洁净微生物聚集体;将所述洁净微生物聚集体置于10ml水中形成洁净微生物聚集体混合液;a5、吸取洁净微生物聚集体混合液,制成玻片,利用数码显微镜获取玻片图像,记录所述玻片图像中微生物聚集体所在区域的R值、G值和B值,并由所述R值、G值和B值计算得到所述微生物聚集体的灰度值;a6、重复a3‑a5,直到获得30组微生物聚集体的比重值和灰度值;采用最小二乘法处理所述30组微生物聚集体的比重值和灰度值,获取待测微生物聚集体样本的灰度值与比重值标准关系曲线;b、以面积和比重值作为两项评价指标,按如下步骤计算待测微生物聚集体样本的评价指标值x<sub>ij</sub>;其中i为评价指标类型,i=1,2;j为待测微生物聚集体编号,j=1,2,…,n;当i=1时,x<sub>1j</sub>为第j个待测微生物聚集体的面积;当i=2时,x<sub>2j</sub>为第j个待测微生物聚集体比重值;具体步骤如下:b1、取含有待测微生物聚集体的混合液制成待测玻片,利用数码显微镜获取待测玻片图像;将所述待测玻片图像的羽化值固定为10,选取所述待测玻片图像中所有的待测微生物聚集体,并从1到n对所有待测微生物聚集体进行编号,n=1,2,3……;记录n个待测微生物聚集体的分辨率、R值、G值和B值;b2、根据b1所得的分辨率、R值、G值和B值,逐一计算n个待测微生物聚集体的灰度值和面积x<sub>1j</sub>;b3、利用步骤a获得的灰度值与比重值标准关系曲线和步骤b2获得的灰度值,分别获取n个待测微生物聚集体的比重值x<sub>2j</sub>;c、采用模糊模式识别方法,对所述待测微生物聚集体的面积x<sub>1j</sub>和比重值x<sub>2j</sub>进行综合评价,获得级别特征值向量H(j),以所述级别特征值向量H(j)作为待测微生物聚集体的评价结果,具体步骤如下:c1、将所述待测微生物聚集体的评价指标值x<sub>ij</sub>写入实测值矩阵X:<maths num="0001" id="cmaths0001"><math><![CDATA[<mrow><mi>X</mi><mo>=</mo><mfenced open='[' close=']'><mtable><mtr><mtd><msub><mi>x</mi><mn>11</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>x</mi><mn>12</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>x</mi><mrow><mn>1</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><msub><mi>x</mi><mn>21</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>x</mi><mn>22</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>x</mi><mrow><mn>2</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>=</mo><mrow><mo>(</mo><msub><mi>x</mi><mi>ij</mi></msub><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000021.GIF" wi="569" he="165" /></maths>c2、将x<sub>ij</sub>的最大值记为y<sub>il</sub>,将x<sub>ij</sub>的最小值记为y<sub>ic</sub>;c3、将x<sub>ij</sub>按评价指标类型分别进行级别分类,每个级别的标准值设为y<sub>ih</sub>,其中y<sub>1h</sub>表示第h个级别面积的标准值,y<sub>2h</sub>表示第h个级别比重值的标准值,设h为1,2,…,5,将y<sub>ih</sub>写入评价指标矩阵Y:<maths num="0002" id="cmaths0002"><math><![CDATA[<mrow><mi>Y</mi><mo>=</mo><mfenced open='[' close=']'><mtable><mtr><mtd><msub><mi>y</mi><mn>11</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>y</mi><mn>12</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>y</mi><mn>15</mn></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><msub><mi>y</mi><mn>21</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>y</mi><mn>22</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>y</mi><mn>25</mn></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>=</mo><mrow><mo>(</mo><msub><mi>y</mi><mi>ih</mi></msub><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000022.GIF" wi="589" he="161" /></maths>c4、根据模糊数学相对隶属度的概念,将实测值矩阵X转化为对应的相对隶属度矩阵R,将评价指标矩阵Y转化为对应的相对隶属度矩阵S:<maths num="0003" id="cmaths0003"><math><![CDATA[<mrow><mi>R</mi><mo>=</mo><mfenced open='[' close=']'><mtable><mtr><mtd><msub><mi>r</mi><mn>11</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>r</mi><mn>12</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>r</mi><mrow><mn>1</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><msub><mi>r</mi><mn>21</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>r</mi><mn>22</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>r</mi><mrow><mn>2</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>=</mo><mrow><mo>(</mo><msub><mi>r</mi><mi>ij</mi></msub><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000023.GIF" wi="701" he="157" /></maths><maths num="0004" id="cmaths0004"><math><![CDATA[<mrow><mi>S</mi><mo>=</mo><mfenced open='[' close=']'><mtable><mtr><mtd><msub><mi>s</mi><mn>11</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>s</mi><mn>12</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>s</mi><mn>15</mn></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><msub><mi>s</mi><mn>21</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>s</mi><mn>22</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>s</mi><mn>25</mn></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>=</mo><mrow><mo>(</mo><msub><mi>s</mi><mi>ih</mi></msub><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000024.GIF" wi="558" he="161" /></maths>其中:<maths num="0005" id="cmaths0005"><math><![CDATA[<mrow><msub><mi>r</mi><mi>ij</mi></msub><mo>=</mo><mfenced open='{' close=''><mtable><mtr><mtd><mn>0</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>x</mi><mi>ij</mi></msub><mo>&le;</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><mfrac><mrow><msub><mi>x</mi><mi>ij</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mrow><mrow><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub><mo>-</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mrow></mfrac></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub><mo>&lt;</mo><msub><mi>x</mi><mi>ij</mi></msub><mo>&lt;</mo><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><mn>1</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub><mo>&le;</mo><msub><mi>x</mi><mi>ij</mi></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000025.GIF" wi="630" he="324" /></maths><maths num="0006" id="cmaths0006"><math><![CDATA[<mrow><msub><mi>s</mi><mi>ih</mi></msub><mo>=</mo><mfenced open='{' close=''><mtable><mtr><mtd><mn>0</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>y</mi><mi>ih</mi></msub><mo>&le;</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><mfrac><mrow><msub><mi>y</mi><mi>ih</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mrow><mrow><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub><mo>-</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub></mrow></mfrac></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>y</mi><mi>ic</mi></msub><mo>&lt;</mo><msub><mi>y</mi><mi>ih</mi></msub><mo>&lt;</mo><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><mn>1</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>y</mi><mrow><mi>i</mi><mn>1</mn></mrow></msub><mo>&le;</mo><msub><mi>y</mi><mi>ih</mi></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000026.GIF" wi="660" he="319" /></maths>c5、判断第j个待测微生物聚集体的面积相对隶属度r<sub>1j</sub>在矩阵S的第1行向量(s<sub>11</sub>,s<sub>12</sub>,...,s<sub>15</sub>)所处的级别上限值b<sub>1j</sub>和级别下限值a<sub>1j</sub>,判断第j个待测微生物聚集体的比重值相对隶属度r<sub>2j</sub>在矩阵S的第2行向量(s<sub>21</sub>,s<sub>22</sub>,...,s<sub>25</sub>)所处的级别上限值b<sub>2j</sub>和级别下限值a<sub>2j</sub>,取a<sub>1j</sub>、a<sub>2j</sub>中最小的值作为第j个待测微生物聚集体的级别下限值a<sub>j</sub>,取b<sub>1j</sub>、b<sub>2j</sub>中最大的值作为第j个待测微生物聚集体的级别上限值b<sub>j</sub>;c6、建立实测值矩阵X的权重矩阵,将所述权重矩阵归一化得综合权重矩阵W:<maths num="0007" id="cmaths0007"><math><![CDATA[<mrow><mi>W</mi><mo>=</mo><mfenced open='[' close=']'><mtable><mtr><mtd><msub><mi>w</mi><mn>11</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>w</mi><mn>12</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>w</mi><mrow><mn>1</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><msub><mi>w</mi><mn>21</mn></msub></mtd><mtd><msub><mi>w</mi><mn>22</mn></msub></mtd><mtd><mo>.</mo><mo>.</mo><mo>.</mo></mtd><mtd><msub><mi>w</mi><mrow><mn>2</mn><mi>n</mi></mrow></msub></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>=</mo><mrow><mo>(</mo><msub><mi>w</mi><mi>ij</mi></msub><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000031.GIF" wi="674" he="175" /></maths>式中w<sub>ij</sub>表示样本j的评价指标i的权重,且<img file="FDA0000560253700000032.GIF" wi="310" he="148" />c7、按式(1)计算级别特征值向量H(j):<maths num="0008" id="cmaths0008"><math><![CDATA[<mrow><mi>H</mi><mrow><mo>(</mo><mi>j</mi><mo>)</mo></mrow><mo>=</mo><munderover><mi>&Sigma;</mi><mrow><mi>h</mi><mo>=</mo><mn>1</mn></mrow><mn>5</mn></munderover><msub><mi>&mu;</mi><mi>hj</mi></msub><mi>h</mi><mo>-</mo><mo>-</mo><mo>-</mo><mrow><mo>(</mo><mn>1</mn><mo>)</mo></mrow></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000033.GIF" wi="911" he="166" /></maths>式(1)中:<maths num="0009" id="cmaths0009"><math><![CDATA[<mrow><msub><mi>u</mi><mi>hj</mi></msub><mo>=</mo><mfenced open='{' close=''><mtable><mtr><mtd><mn>0</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><mi>h</mi><mo>&lt;</mo><msub><mi>a</mi><mi>j</mi></msub><mi>or</mi><mo>,</mo><mi>h</mi><mo>></mo><msub><mi>b</mi><mi>j</mi></msub></mtd></mtr><mtr><mtd><mfrac><mn>1</mn><mrow><munderover><mi>&Sigma;</mi><mrow><mi>k</mi><mo>=</mo><msub><mi>a</mi><mi>j</mi></msub></mrow><msub><mi>b</mi><mi>j</mi></msub></munderover><mo>{</mo><mfrac><mrow><munderover><mi>&Sigma;</mi><mrow><mi>i</mi><mo>=</mo><mn>1</mn></mrow><mn>2</mn></munderover><mo>[</mo><msub><mi>w</mi><mi>ij</mi></msub><mrow><mo>(</mo><msub><mi>r</mi><mi>ij</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>s</mi><mi>ih</mi></msub><mo>)</mo></mrow><msup><mo>]</mo><mn>2</mn></msup></mrow><mrow><munderover><mi>&Sigma;</mi><mrow><mi>i</mi><mo>=</mo><mn>1</mn></mrow><mn>2</mn></munderover><mo>[</mo><msub><mi>w</mi><mi>ij</mi></msub><mrow><mo>(</mo><msub><mi>r</mi><mi>ij</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>s</mi><mi>ik</mi></msub><mo>)</mo></mrow><msup><mo>]</mo><mn>2</mn></msup></mrow></mfrac><mo>}</mo></mrow></mfrac></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>a</mi><mi>j</mi></msub><mo>&le;</mo><mi>h</mi><mo>&le;</mo><msub><mi>b</mi><mi>j</mi></msub><mo>,</mo><msub><mi>d</mi><mi>hj</mi></msub><mo>&NotEqual;</mo><mn>0</mn></mtd></mtr><mtr><mtd><mn>1</mn></mtd><mtd><mo>,</mo><msub><mi>d</mi><mi>hj</mi></msub><mo>=</mo><mn>0</mn></mtd></mtr></mtable></mfenced><mo>;</mo></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000034.GIF" wi="1316" he="645" /></maths><maths num="0010" id="cmaths0010"><math><![CDATA[<mrow><msub><mi>d</mi><mi>hj</mi></msub><mo>=</mo><mo>{</mo><munderover><mi>&Sigma;</mi><mrow><mi>i</mi><mo>=</mo><mn>1</mn></mrow><mn>2</mn></munderover><mo>[</mo><msub><mi>w</mi><mi>ij</mi></msub><mrow><mo>(</mo><msub><mi>r</mi><mi>ij</mi></msub><mo>-</mo><msub><mi>s</mi><mi>ih</mi></msub><mo>)</mo></mrow><msup><mo>]</mo><mn>2</mn></msup><msup><mo>}</mo><mfrac><mn>1</mn><mn>2</mn></mfrac></msup><mo>.</mo></mrow>]]></math><img file="FDA0000560253700000035.GIF" wi="1072" he="193" /></maths>
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