Oligonucleotides, the nucleotide sequence of the gene fragment of the fusion protein F of Newcastle Disease virus (NDV), the use of the nucleotide sequence for the detection and differentiation of different strains of NDV

摘要

Przedmiotem wynalazku są oligonukleotydy, konserwowana sekwencja nukleotydowa wchodząca w skład genu kodującego białko F, wirusa rzekomego pomoru drobiu (Newcastle Discase Virus, NDV, APMV-1), zastosowanie sekwencji nukleotydowej do detekcji i różnicowania szczepów NDV. Oligonukleotydy o sekwencji DNA charakteryzuje się tym, że służą do powielenia fragmentów genu białka fuzyjnego w obrębie ewolucyjnie silnie zachowanego fragmentu tego genu dla wirusów APMV-1, należącego do rodziny Paramyxoviridae, rodzaju Avulavirus. Sekwencja nukleotydowa DNA charakterystyczna tym, że zawiera sekwencję wybraną spośród sekwencji DNA lub DNA transkrybowanego z RNA, dla fragmentów genu kodującego białko fuzyjne wirusa rzekomego pomoru drobiu zawartych w przedziałach 247-256 oraz 350-369 par zasad liczonych od początku genu F identyfikowanego jako Newcastle Disease Virus, NDV, APMV-1. Wynalazek obejmuje również zastosowanie sekwencji nukleotydowej starterów DNA, które charakteryzuje się tym, że używa się starterów służących do powielenia fragmentów genu kodującego białko fuzyjne wirusa rzekomego pomoru drobiu w obrębie ewolucyjnie silnie zachowanego fragmentu tego genu do detekcji i różnicowania odmiennych szczepów NDV Newcastle Disease Virus oraz zastosowanie sekwencji nukleotydowej starterów powielenia odcinka DNA przeprowadza się reakcję RT-PCR i analizuje się produkty tej reakcji, rozdzielając je na żelu agarozowym lub żelu poliakrylamidowym, a następnie barwi się DNA i przeprowadza oględziny w promieniowaniu pod lampą UV.