一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6-Chr1^C3H/HeJ的构建

摘要

本发明涉及一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6-Chr1^C3H/HeJ的构建。本发明构建了一种新的染色体替代实验小鼠品系，该小鼠品系的遗传背景以C57BL/6小鼠为主，但其中1号染色体来自于C3H/HeJ小鼠。本发明的染色体替换品系可用于研究在相同基因组背景下，由不同的1号染色体基因组带来的性状差异，是采用遗传学方法研究染色体基因组功能的有用工具。

主权项

一种1号染色体替换实验小鼠品系C57BL/6‑Chr1^C3H/HeJ的建立方法，其特征在于，所述方法包括： (1)以C3H/HeJ品系小鼠作为母本、C57BL/6品系小鼠作为父本进行杂交，获得F1代小鼠； (2)将F1代雄性小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得回交一代小鼠；该回交小鼠中，C3H/HeJ品系小鼠中的性染色体和线粒体DNA被替换为C57BL/6品系小鼠中的性染色体和线粒体DNA；使用多核苷酸多态性位点鉴定该雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为C3H/HeJ品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为C3H/HeJ品系小鼠所特有的回交小鼠； (3)将选择到的雄性回交小鼠与C57BL/6品系雌性小鼠杂交，获得下一代回交小鼠； (4)使用多核苷酸多态性位点鉴定雄性回交小鼠的1号染色体，选择1号染色体多核苷酸多态性位点鉴定结果为C3H/HeJ品系小鼠所特有的雄性回交小鼠；使用短串联重复序列位点鉴定选择到的雄性回交小鼠，选择1号染色体短串联重复序列位点鉴定结果为C3H/HeJ品系小鼠所特有的回交小鼠； (5)重复步骤(3)～(4)5‑50次；从而获得染色体替代动物品系，其以C57BL/6品系小鼠为背景，且其1号染色体被C3H/HeJ品系小鼠的1号染色体替换； 其中，所述的1号染色体的多核苷酸多态性位点包括： rs32539840，其在1号染色体上所处位置为chr1：35672358；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs32396447，其在1号染色体上所处位置为chr1：37448015；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T； rs32139742，其在1号染色体上所处位置为chr1：40806614；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs31336640，其在1号染色体上所处位置为chr1：47136503；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs30146639，其在1号染色体上所处位置为chr1：76144828；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs32011713，其在1号染色体上所处位置为chr1：79917356；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs32495825，其在1号染色体上所处位置为chr1：124737843；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs30694738，其在1号染色体上所处位置为chr1：142191205；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为A，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为G； rs3678938，其在1号染色体上所处位置为chr1：158391632；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs31551026，其在1号染色体上所处位置为chr1：173280204；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为T，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为C； rs6181686，其在1号染色体上所处位置为chr1：195479631；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为G，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为A； rs32357522，其在1号染色体上所处位置为chr1：196467358；在C3H/HeJ品系小鼠染色体相应位置的碱基为C，在C57BL/6品系小鼠染色体相应位置的碱基为T； 其中，所述的1号染色体的短串联重复序列位点包括： D1MIT64，其在1号染色体上所处位置为3.7cM；在C3H/HeJ品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异18bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多9个2bp碱基重复； D1MIT303，其在1号染色体上所处位置为32cM；在C3H/HeJ品系小鼠 基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异6bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多3个2bp碱基重复； D1mit49，其在1号染色体上所处位置为44cM；在C3H/HeJ品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异6bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多3个2bp碱基重复； D1MIT506，其在1号染色体上所处位置为71cM；在C3H/HeJ品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异4bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多2个2bp碱基重复； D1MIT150，其在1号染色体上所处位置为81cM；在C3H/HeJ品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异12bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多6个2bp碱基重复； D1MIT209，其在1号染色体上所处位置为96cM；在C3H/HeJ品系小鼠基因组和C57BL/6品系小鼠染色体中，相应位置上基因序列长度差异10bp，C57BL/6品系小鼠比C3H/HeJ品系小鼠多5个2bp碱基重复。