肿瘤或肿瘤细胞中上皮或间充质表型的诊断性甲基化标志物和对EGFR激酶抑制剂的响应

摘要

本发明提供用于测定肿瘤的上皮和间充质表型以及预测肿瘤生长对使用EGFR抑制剂治疗为敏感还是抗性的方法。具体地，提供在至少一种选自下组的基因中的CpG位点处DNA甲基化的存在或缺失作为肿瘤细胞间充质表型的标志物，用于确定肿瘤生长对EGFR激酶抑制剂所致抑制的敏感性，和/或鉴定很可能受益于使用EGFR抑制剂治疗的癌症患者：CLDN7、HOXC4、CP2L3、TBCD、ESPR1、GRHL2、ERBB2和C20orf55。提供在至少一种选自下组的基因中的CpG位点处DNA甲基化的存在或缺失作为肿瘤细胞上皮表型的标志物：PCDH8、PEX5L、GALR1和ZEB2。

主权项

一种测定肿瘤细胞是否具有间充质表型的方法，其包括检测至少一种选自下组的基因中CpG位点处DNA甲基化的存在或缺失：CLDN7、HOXC4、P2L3、TBCD、ESPR1、GRHL2、ERBB2和C20orf55，其中所述CpG位点处甲基化的存在指示肿瘤细胞具有间充质表型。