用于检测核苷酸修饰的方法

摘要

本发明涉及修饰的胞嘧啶残基，如5-甲基胞嘧啶（5mC）、5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和5-甲酰基胞嘧啶（5fC）的识别，以与样品核苷酸序列中的胞嘧啶（C）区别开来。本方法可包括氧化或还原包括样品核苷酸序列的多核苷酸的第一部分；用重亚硫酸盐处理氧化的或还原的多核苷酸的第一部分和第二部分；在步骤ii）和iii）后，测序群体中第一和第二部分中的多核苷酸，以分别生成第一和第二核苷酸序列，以及；识别对应于样品核苷酸序列中胞嘧啶的第一和第二核苷酸序列中的残基。这些方法例如可用于基因组DNA和/或RNA的分析中。

主权项

一种在样品核苷酸序列中识别修饰的胞嘧啶残基的方法，包括；(i)提供包括所述样品核苷酸序列的多核苷酸群体，(ii)氧化或还原所述群体的第一部分，(iii)用重亚硫酸盐处理氧化或还原的所述群体的第一部分和所述群体的第二部分，(iv)在步骤ii)和iii)后，测序所述群体的所述第一和第二部分中的多核苷酸，以分别生成第一和第二核苷酸序列，以及；(v)识别对应于所述样品核苷酸序列中胞嘧啶残基的所述第一和第二核苷酸序列中的残基。