水稻基因组学的研究方法

摘要

本发明涉及一种水稻基因组学的研究方法，本发明根据粳稻日本晴全基因组BAC序列与籼稻93-11全基因组序列BLAST分析的结果，开发基于籼稻-粳稻第1染色体序列差异的特异InDel标记，还对所设计引物在2个籼稻和5个粳稻品种之间进行多态性鉴定，获得分子标记除了在籼稻-粳稻亚种之间具有多态性之外，一些标记在亚种内也具有多态性，因此这些引物可以用于同一亚种间多态性鉴定。甚至少数标记对来自于同一遗传背景及其相应突变体之间有多态性。可以预见，开发的分子标记在籼稻-粳稻遗传分化、籼稻-粳稻杂种优势的分子机制解释、分子标记辅助育种等方面具有重要利用价值。

主权项

根据各对引物在（日本晴）染色体上的具体位置等相关信息，构建了水稻第1染色体的InDel分子标记的物理图谱，该图谱包括86对InDel分子标记，平均每1cM分布0.47对标记，平均每对引物的物理间隔为0.52Mb。