检测11q23/MLL融合基因相对表达量的方法、引物和探针

摘要

本发明公开了检测11q23/MLL系列的4种融合基因的方法，以及用于检测11q23/MLL系列的4种融合基因共计16种融合类型的相对表达量的引物、探针。上述引物和探针经测试特异性好，灵敏度高，操作简便，利用Taqman探针实时荧光定量PCR的方法，并基于看家基因与目的基因的“双标准曲线”法分析所得数据，可用于检测ALL（急性淋巴细胞白血病）、AML（急性粒细胞白血病）和MDS（骨髓增生异常综合征）患者体内11q23/MLL系列融合基因mRNA相对表达水平，同时对高危人群进行较为准确的筛查，可有效地节约检测时间，提高检测精度。

主权项

用于检测11q23/MLL系列的MLL‑AF4、MLL‑AF6、MLL‑AF9和MLL‑ENL 4种融合基因相对表达量的引物和探针，其特征在于：所述引物和探针包括：（1）检测11q23/MLL系列的4种融合基因的共用上游引物MLL‑F1、MLL‑F2和共用探针P1、P2；其中MLL‑F1：CAGCACTGGTCATCCCGCCTCMLL‑F2：CAATAAGCAGGAGAATGCAGP1：FAM‑ ACTACAGGACCGCCAAGAAAAGAAGTTCC‑TAMRAP2：FAM‑ AGCACTCTCTCCAATGGCAATAGTTCTAAG–TAMRA；（2）检测MLL‑AF4的4种融合类型的下游引物AF4‑R1、AF4‑R2，其中：AF4‑R1：CTTCGAGCATGGATGACGTAF4‑R2：GCCATGAATGGGTCATTTC（3）检测MLL‑AF6的2种融合类型的下游引物AF6‑R，其中：AF6‑R：CTTTCTCCGCTGACATGCACTTCA（4）检测MLL‑AF9的6种融合类型的下游引物AF9‑R1、AF9‑R2、AF9‑R3，其中：AF9‑R1：GATCTGCTGCAGAATGTGTCTAF9‑R2：GGACTGGGTTGTTCAGAATAF9‑R3：TGCTGCTGCTGCTGCTGGTAT（5）检测MLL‑ENL的4种融合类型的下游引物AF9‑R1、AF9‑R2、AF9‑R3，其中：ENL‑R1：TTGGACGGGCTTGACTGGGENL‑R2：GCTTCTTGCGCAGTTGGG（6）检测内参基因abl的引物abl‑F，abl‑R，探针abl‑Probe；其中，abl‑F：GCCGTGAAGACCTTGAAGGAGabl‑R：ATGATATAGAACGGGGGCTCabl‑Probe：FAM‑ACCTGGTGCAGCTCCTTGGG‑TAMRA。