油茶SSR分子标记

摘要

一种油茶SSR分子标记，包括油茶DNA序列的获得及预处理、DNA序列中SSR位点的检索、SSR引物的设计与合成、SSR标记体系的建立、多态性SSR标记的筛选。检索利用454测序得到油茶基因组序列及EST序列中含有简单序列重复单元的、符合条件的序列，筛选得到12个多态性丰富的SSR标记CO_gSSR11、CO_gSSR12、CO_gSSR14、CO_gSSR16、CO_gSSR19、CO_gSSR20、CO_eSSR01、CO_eSSR04、CO_eSSR16、CO_eSSR40、CO_eSSR44、CO_eSSR48。本发明适用于油茶种质资源的遗传评价、种质鉴定及分子标记辅助育种研究，重复性好、可靠性高，是一种非常有效的分子标记。

主权项

1.一种油茶SSR分子标记，其特征包括：微卫星分子标记编号、微卫星分子标记所对应的核苷酸序列、微卫星分子标记所对应的12个位点的引物序列； 所述的微卫星标记编号为：CO_gSSR11、CO_gSSR12、CO_gSSR14、CO_gSSR16、CO_gSSR19、CO_gSSR20、CO_eSSR01、CO_eSSR04、CO_eSSR16、CO_eSSR40、CO_eSSR44、CO_eSSR48； 所述微卫星分子标记所对应的核苷酸序列分别为： 所述12个位点为：CO_gSSR11、CO_gSSR12、CO_gSSR14、CO_gSSR16、CO_gSSR19、CO_gSSR20、CO_eSSR01、CO_eSSR04、CO_eSSR16、CO_eSSR40、CO_eSSR44、CO_eSSR48， 各位点所对应的引物序列分别为： CO_gSSR11F：GCACAATCCTTTCACTTT CO_gSSR11R：TGTTTGAGGTACAACCGT CO_gSSR12F：ACAAGGAGGAGAACGAAT CO_gSSR12R：CACGCTCCCACTACATAA CO_gSSR14F：TGGGGTATTCTTTTGCTT CO_gSSR14R：CAGTACACCTCACTTGGA CO_gSSR16F：CCATCTTCGTTGCTATTA CO_gSSR16R：CGGTGATGACGAGGTGAG CO_gSSR19F：TTAGTTTAGCCAAACTTG CO_gSSR19R：ACTCTTTAGTTGATCAGATG CO_gSSR20F：TGGTGGTCTGATAGTGCC CO_gSSR20R：ATGCGAGCTTCATTGTTA CO_eSSR01F：ACTCCCAGTCACCTCCCT CO_eSSR01R：CAAAGCCTCGAAATCGTC CO_eSSR04F：GTGGGCAAGGCAACAAAT CO_eSSR04R：TGAGGGAGCAAAGGTAGA CO_eSSR16F：AGAACCCTCCATTGAAAC CO_eSSR16R：GTCCTCGTCCAAGAAGTA CO_eSSR40F：CGCCAACAACCTCCGACAA CO_eSSR40R：GCGGCAGAAAGCACAGCAA CO_eSSR44F：ATTTGCGGGTATGGATGT CO_eSSR44R：GTGGCTCAACTGGAAGGA CO_eSSR48F：GAAAGCACAGCGAAGAGC CO_eSSR48R：GCAGACACCGTGGACAAG。